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北京青莲百奥生物科技有限公司
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mRNA测序
转录组指的是特定细胞在某一状态下所有转录产物的集合,包括了编码的mRNA和非编码RNA,例如lncRNA,miRNA,circRNA等,下面小编就来介绍下普通转录组(mRNA)测序服务。
产品简介
普通转录组测序就是对特定物种或者特定细胞在某一功能状态下产生的所有mRNA进行的测序。将生物样本中的RNA反转录为cDNA,构建测序文库,利用二代测序平台得到序列,进行生物信息学分析;全面快速地获得某一物种特定组织在某一状态下的所有转录本。
技术路线
注:真核生物采用Oligo dT磁珠富集法,原核生物采用去rRNA法来富集mRNA。
技术优势 检测不受物种限制
不依赖于参考基因组,对于无参基因组的物种也可以进行转录组测序以及后续分析
检测范围广泛可直接对任意物种进行转录组测序,可以同时鉴定己知的、稀有低丰度的和新的转录本
高质量数据产出实验过程中严格按照质控标准,保证数据可靠性。测序结果精确到单个碱基,可检测到由可变剪切造成的单个碱基差异。
资深的生信分析团队测序数据可被用来分析基因表达差异,基因功能分析以及鉴定新的转录木信息以及个性化分析
优质的一站式股务 专业的技术团队为您提供1V1的一站式服务,让您时刻了解项目动态。测序策略
样本要求
数据分析
根据测序物种有无参考基因组可以分为有参转录组测序和无参转录组测序。分别可以得到的生信分析如下:
有参转录组测序生信分析

无参转录组测序生信分析

部分数据展示
组间的差异基因Venn 图

差异表达基因聚类热图

样品PCA 分析图

差异基因GO Terms 富集结果top20 散点图

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服务周期:样本质控合格后30个工作日
技术优势
[1]Huang Yingmei,Chen Huiqiong,Reinfelder John R,Liang Xiaoyu,Sun Chongjun,Liu Chuanping,Li Fangbai,Yi Jicai. A transcriptomic (RNA-seq) analysis of genes responsive to both cadmium and arsenic stress in rice root.[J]. The Science of the total environment,2019,666.
[2]Kundu Anirban,Singh Pankaj Kumar,Dey Avishek,Ganguli Sayak,Pal Amita. Complex molecular mechanisms underlying MYMIV-resistance in Vigna mungo revealed by comparative transcriptome profiling.[J]. Scientific reports,2019,9(1).
[3]Yan Yong-Wei,Zou Bin,Zhu Ting,Hozzein Wael N,Quan Zhe-Xue. Modified RNA-seq method for microbial community and diversity analysis using rRNA in different types of environmental samples.[J]. PloS one,2017,12(10).
[4]Peng Wu,Shuo Yang,Sandeep Singh,Fujun Qin,Shailesh Kumar,Ling Wang,Ding Ma,Hui Li. The Landscape and Implications of Chimeric RNAs in Cervical Cancer[J]. EBioMedicine,2018,37.
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