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Hanbio汉恒生物
简介
miRNAs与靶基因的3’UTR结合后,一般功能主要表现为抑制mRNA的翻译,为了检测其效果,我们可以用Western Blot的方法检测靶蛋白的表达水平,也可以用qRT-PCR进行检测靶标基因的表达。但是这两种方式都不能有效地说明是miRNAs直接起作用的结果。因此为了检测miRNA靶标的有效性,构建Sensor reporter并进行活性检测,才是对miRNAs与靶基因3’UTR的关系作出准确判断的方法。
服务优势
(1)采用Promega公司特有psiCHECK质粒;
(2)所采用的Luciferase双荧光报告系统,可以获得宽泛的线性定量范围与极高的灵敏度;
(3)采用瞬时转染技术,操作简便、快速,周期短,适用于绝大多数细胞类型。
服务流程
(1)PCR扩增靶基因的3’UTR,或直接合成结合位点序列;
(2)将上述确定的靶基因DNA片段克隆至报告基因载体psiCHECK质粒;
(3)克隆miRNA表达载体;
(4)将报告载体与miRNA表达载体共转染293T细胞;
(5)多功能酶标仪检测报告基因的表达水平;
(6)数据分析,整理提交客户原始数据及项目报告;
注:为了实验的严谨性,可加入靶标基因3’UTR区microRNA预测结合区域的突变体作为对照,进一步说明问题。
附:psiCHECK质粒图谱

汉恒生物实例:
汉恒生物通过合成mimics,构建可能靶基因的3’UTR报告基因系统成功验证miRNA与靶基因的关系。

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文献和实验山大真大 :):):) 我最近在做一个ncRNA 的项目,希望大家能给我提供几款靶基因预测的软件 我自己找过很多但都下不下来。。。 最好能顺便提供教程 zhujoker 呵呵,ncRNA可是一个大范围啊?你需要什么样的靶基因预测的软件?你做的是什么ncRNA,能否说的明确一点? 山大真大 TargetScan miRanda DIANA2MicroT PicTar
wh861017 求助:我用了三个综合性miRNA靶基因预测软件:starBase、miRecords、TarBase预测miR-155和miR-30a的靶基因,怎么每个软件预测的靶基因个数不一样,而且有的已经被证实的靶基因缺不在预测的靶基因范围内,我该相信哪个软件?急!!!!! charllu 你可以在PICTAR、MIRBASE、DIANA-MICROT或者Targetscan上再看看,一般这几个网站是比较权威的预测
相关专题 解读miRNA (MicroRNA) miRNA 靶基因预测 与miRNA基因预测相比,靶基因的预测具有更大的难度. 因为目前已知的miRNA靶基因数量非常有限,不能为预测提供充足的依据,而且对预测的候选基因的鉴定步骤相对繁琐,很难实现高通量和规模化. 从已知的miRNA与靶基因的相互作用中,人们得出miRNA5′端的2~8 个核苷酸几乎无一例外地与靶mRNA 3′端UTR 区完全互补
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