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文献和实验Combined 3C-ChIP-Cloning (6C) Assay: A Tool to Unravel Protein-Mediated Genome Architecture
antibiotic (see Step 51). Ligation buffer (10X) Dilute the 10X stock to 1.15X for Step 18. Magnetic beads, Protein A-conjugated Magnetic beads, Protein G-conjugated PCR buffer (10X) PCR primers, T3 and T7 Phenol
了。 4、sonication:ChIP 中最重要的一部分,合适的条件要自己摸索,可以一次尝试不同次数的 sonication,然后建议采用 EZ-ChIP 上推荐的方法看看 sonication 的效果如何。 5、加入 salmon sperm DNA/Protein A or G 之前要先混匀,因为salmon sperm DNA 是很粘稠的物质,若不混匀,后面你会发现 beads的量不一样,自然也会影响实验的结果。 6、wash 的时候前面几个步骤可以不用洗的太干净,但最后一个要尽量吸干净,必要时可用 gel
Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
for ChIP PCR or real-time PCR primers Phenol:chloroform (pH 8.0) Phosphate-buffered saline (PBS) (1X) Protease inhibitors (Roche) Protein A-agarose/salmon sperm DNA beads (Millipore) or Protein G-agarose/salmon sperm DNA beads
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