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BioNano Saphyr平
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上海仁科
升级二 仪器和芯片升级使数据多又好今年年初,Bionano推出新版本的Saphyr平台及Saphyr chip,新平台有两个芯片位,可连续对两张芯片进行数据的收集。而新版的Saphyr chip单张芯片有三个上样FlowCell,每个上样FlowCell可获得1300GB的实验数据,单张芯片可获得高达3900Gbp的数据。运行时间上可在12个小时内完成3个人类样本的检测(100X),每周完成42个样本的检测。
升级三 标记方法升级提高检测读长DLS标记技术是BioNano去年推出的一款新的标记技术,该技术采用直接标记技术,不需要对双链DNA进行切割标记,从而不产生任何物理损伤,避免了NLRS标记技术中由于DNA链切割位置的重叠而造成的双链DNA片段的断裂,提高了检测分子长度。
如下图为采用SP的DNA抽提方法,DLS的标记方法获得的数据,其N50高达320kbp以上,map rate在90%以上。
升级四 软件升级提高检测灵敏度通过升级的SP基因组DNA抽提方法,以及新版Saphyr平台及Saphyr chip,可拿到高质量高通量的数据。更让人兴奋的是数据分析软件Bionano Solve和Access也升级了,目前最新版本为Bionano Solve v 3.4和Bionano Access v1.4,新升级的Bionano Solve SV pipeline能够在高灵敏度和PPV下检测低等位基因片段的结构变异。当数据为300x的覆盖度,等位基因频率为5%时:Bionano Solve v 3.4对易位、倒置(> 70 kbp)、缺失(>5 kbp)、插入(5-50 kb)、重复(70-300 kbp)的结构变异检测灵敏度在90%以上。在1000x 的覆盖度下,低至1.5%的等位基因也能够被检测到。
BionanoAccess复杂重组进行可视化展示
BioNano高分文章列表(部分) 更多文章可参见网址http:// https://bionanogenomics.com/library/publications上海仁科生物作为BioNano Genomics的代理商,如果您想了解更多BioNano Genomics信息,欢迎致电(021)34250079或者给我们发邮件,邮箱marketing@bio-star.cn。
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