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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
负20度
- 英文名:
Paenibacillus larvae
- 供应商:
上海圻明
- 规格:
50次
PCR引物不需要设计限制性内切酶识别序列
PCR产物不必进行酶切、末端补平或添加接头等处理
高拷贝的载体和通用的引物序列,便于测序、扩增、酶切
幼虫芽孢杆菌LAMP试剂盒产品及特点 本试剂盒是整合 cDNA 第一链合成试剂(RT 试剂盒)和即用型 qPCR 试剂而得的qRT-PCR 试剂盒。cDNA 第一链合成反应和 qPCR 反应分别在两个离心管中进行。本试剂盒具有下列特点:
1. 即开即用,足够 50 次 RT 反应(10uL 体系)和 50 次 qPCR 反应(20 uL 体系)。
2. RT 和 PCR 分开进行,方便优化 RT 和 qPCR 条件,也方便一个 RT 反应用于多个不同引物的 qPCR 扩增。
3. RT mix 中含除酶、模板和引物以外的 RT 成分,简化了反应设置步骤。
4. qPCR mix 是 2×预配液,也简化了反应设置步骤。
5. qPCR mix 含 qPCR 染料,无需另外加入相关荧光 PCR 染料。
6. 扩增效率高, 最长可扩增 5 Kbp 以上的 RNA。
7. 提供定量 PCR 专用模板稀释液,保证在制作标准曲线时低浓度样品的准确性。
qPCR(20 uL 体系)
8、在每个 PCR 管中加入下列成分:
成分 加入量
qPCR MagicMix 10 uL
cDNA 样品(来于上步的 RT 反应) 2 uL
PCR 正向引物(10 pmol/uL) 1 uL
PCR 反向引物(10 pmol/uL) 1 uL
自备 ROX 染料 I 或 II(见注) 2 uL
RNase-free 水 4 uL
注意:如果使用 ABI 公司的 7500,7700 和 7900 三种型号的荧光 PCR 仪器,则需用自备的 ROX 进行 Ct 值校正。对 ABI 7700 和 7900,ROX 的最佳浓度为 1×(即
在每 20 uL 反应体系中加 2 uL 10×ROX)。对 ABI 7500, ROX 的最佳浓度为0.05-0.1×(每 20 uL 反应体系加 0.1-0.2 uL 10×ROX;也可将 10×ROX 稀释到
1×,然后每个反应体系加入 1-2 uL 1×ROX)。ROX 会在溶解曲线中产生噪音,因此,如果出现了杂峰,将软件中“Passive Reference Dye”中的“ROX”选项取消打
勾,然后重新分析数据。
对于iCycler IQ,MJ Opticon,MJ Chromo4,MX3000,MX4000, RotorGene3000,RotorGene 6000 和 LightCycler 480 等型号的荧光 PCR 仪器,ROX 不是必须的,
但加入的话也不会影响整个 PCR 分析。
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文献和实验引起破伤风;肉毒梭菌、产气荚膜梭菌和蜡状芽孢杆菌引起食物中毒;韦氏梭菌和产气荚膜梭菌引起气性坏疽。对人有利的芽孢菌有枯草芽孢杆菌,产生工业或医疗用的蛋白酶、淀粉酶;丙酮丁醇梭菌用于生产丙酮丁醇;多粘芽孢杆菌生产多粘菌素;地衣芽孢杆菌生产杆菌肽;著名的细菌杀虫剂——苏云金芽孢杆菌能杀死100多种鳞翅目的农林害虫,现已扩大到杀蚊、蝇幼虫;日本甲虫芽孢杆菌、幼虫芽孢杆菌和缓病芽孢杆菌可用于防治蛴螬等地下害虫。芽孢杆菌分解有机物能力强,在自然界的元素循环中起重要作用。有些种(如多粘芽孢杆菌和巴氏梭菌
释放酶活;一类是抗体法修饰的热启动酶,如 Champagne Taq ,预变性 95℃30s 即可释放酶活。使用时注意预变性时间,方能获得满意的扩增效果。 2. 选择 Lamp 扩增长片段 大于 5Kb 的长片段又该如何扩增呢?如果实验对保真度的需求不高,那么就可以使用 LAmp DNA 聚合酶。其保真度是 Taq 酶的 6 倍,可扩增超过 20Kb 的基因组、cDNA 片段,对于低拷贝、低纯度、以及不同 GC 含量的模板都具有很高的成功率。 3. 选择高保真酶快速高效扩增 如果实
D 型氨基酸氧化酶(DAAO)与过氧化氢检测试剂盒联用,对产物中的 D 型氨基酸的总量进行评价。结果显示只有芽孢杆菌属和类芽孢杆菌属的肠道菌能够产生 D 型氨基酸,且在芽孢杆菌属内,菌株在种和菌株的水平上产 D 型氨基酸的能力也有差异,并与 16S rRNA 相似度没有明显的相关性(图 2),暗示单纯依靠 16S rRNA 测序获得微生物组菌种组成信息,无法准确预测菌群合成 D 型氨基酸的水平。 图 2:DAAO 法评估大鼠肠道菌生产 D 型氨基酸的能力与 16S rRNA 的关系 最后
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