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56795S, SimpleC
hIP® ChIP-seq DNA Library Prep Kit for Illumina®| 产品包括 | 容量（计数） | 保存温度 | |||
|---|---|---|---|---|---|
| End Prep Enzyme Mix | 1 x 72 µl | -20°C | |||
| End Prep Reaction Buffer | 1 x 168 µl | -20°C | |||
| Ligation Enhancer | 1 x 24 µl | -20°C | |||
| Ligation Master Mix | 1 x 720 µl | -20°C | |||
| Q5® PCR Master Mix | 1 x 600 µl | -20°C |
下一代测序分析 (NG-seq) 是一种高通量方法，可在染色质免疫沉淀 (ChIP) 检测的下游用来检测和定量全基因组中的靶标 DNA 富集度。SimpleChIP® ChIP-seq DNA Library Prep Kit for Illumina® 含有在 Illumina® 平台上使用 ChIP DNA 进行下一代测序分析来产生高质量 DNA 测序库所必需的所有酶和缓冲液。快速、人性化的工作流程可最大程度地缩短产生和纯化 DNA 库的亲自动手时间。本产品必须与 SimpleChIP® ChIP-seq Multiplex Oligos for Illumina® (Single Index Primers) #29580 或 SimpleChIP® ChIP-seq Multiplex Oligos for Illumina® (Dual Index Primers) #47538 结合使用。
本产品包含的试剂量足以进行 24 次反应，并且适合酶解和超声处理碎裂的 ChIP 富集的 DNA。本产品适合 SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9003、SimpleChIP®Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 和 SimpleChIP® Plus Sonication Chromatin IP Kit #56383。该产品不适合 SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads) #9002 和 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads) #9004，因为琼脂糖微珠会封阻经超声处理的鲑鱼精 DNA，这会污染 DNA 库制备和 NG-seq。
该试剂盒经验证可与 SimpleChIP® ChIP-seq Multiplex Oligos for Illumina® (Single Index Primers) #29580 或 SimpleChIP® ChIP-seq Multiplex Oligos for Illumina® (Dual Index Primers) #47538 结合使用，以将 50 ng、5 ng 或 0.5 ng ChIP DNA 用作起始物质来产生合格的 DNA 库。使用不同起始量的 ChIP DNA 制备的库显示，Bioanalyzer® 特征、基因组比对率、发现的结合波峰数量以及全基因组信噪比均相似。
染色质免疫沉淀 (ChIP) 测定法是一种用于在细胞天然染色质背景下探测蛋白质-DNA 相互作用的强大的通用技术 (1,2)。这种测定法用于检测与基因组某个特定区域有关的多种蛋白，或相反，用于检测某种特殊蛋白结合的基因组的多个区域 (3-6)。它可用于确定各种蛋白被募集到某个基因启动子上的特定顺序，或用于“测定”整个基因位点上某种特定组蛋白修饰的相对数量 (3,4)。除了组蛋白外，ChIP 测定法还可用于分析转录因子与辅助因子、DNA 复制因子和 DNA 修复蛋白的结合。进行 ChIP 检测时，细胞或组织首先用甲醛固定，甲醛是一种可逆的蛋白-DNA 交联剂，可“维持”细胞中发生的蛋白-DNA 相互作用 (1,2)。细胞进行裂解，染色质采集后使用超声处理或酶消化法进行碎裂。染色质随后使用对某种特殊蛋白或组蛋白修饰具有特异性的抗体进行免疫沉淀。任何与目标蛋白或组蛋白修饰有关的 DNA 序列都会作为交联染色质复合体的一部分进行共沉淀，并且该 DNA 序列的相对数量会在免疫选择过程中达到富集。免疫沉淀后，蛋白质-DNA 交联被逆转，DNA 得以纯化。标准 PCR 或定量实时 PCR 用于测量通过蛋白特异性免疫沉淀达到富集的某种特定 DNA 序列的数量 (1,2)。或者，ChIP 测定法还可与基因组微芯片（芯片上的 ChIP）技术、高通测序或克隆策略联合使用，它们都能对蛋白-DNA 相互作用和组蛋白修饰进行全基因组分析 (5-8)。
| 货号 | 产品名称 | 应用 |
| 56383S | SimpleChIP® Plus Sonication Chromatin IP Kit（超声法，磁珠） | ChIP ChIP-seq |
| 9005S | SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads)（酶解法，磁珠） | ChIP ChIP-seq |
| 9004S | SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads)（酶解法，琼脂糖微珠） | ChIP |
| 9003S | SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads)（酶解法，磁珠） | ChIP ChIP-seq |
| 9002S | SimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads)（酶解法，琼脂糖微珠） | ChIP |
| 56795S | SimpleChIP® ChIP-seq DNA Library Prep Kit for Illumina®（DNA 文库构建） | ChIP-seq |
Cell Signaling Technology 是 Cell Signaling Technology, Inc. 的商标。
SimpleChIP 是 Cell Signaling Technology, Inc. 的注册商标。
AMPure 是 Beckman Coulter, Inc. 的注册商标
Bioanalyzer 是 Agilent Technologies, Inc 的注册商标
Illumina 是 Illumina, Inc 的注册商标。
Q5 是 New England Biolabs, Inc. 的注册商标
SPRIselect 是 Beckman Coulter, Inc. 的注册商标
USER Enzyme 是 New England Biolabs, Inc. 的注册商标
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