山羊抗鼠IgG(Fc)铁磁珠

如何用 R 语言绘制火山图？

测序技术的火爆程度，大家有目共睹，做了测序就一定会涉及差异分析的表达，差异分析最常用的就是「火山图」和「热图」了。看看这两种图形在顶级期刊中的出场率！图片来源：各期刊截图这两种图形最常用的是用 R 语言绘制，但很多人不知道 GraphPad prism 软件同样也可实现。今天，我们就两种图形的 R 语言和 GraphPad prism 画法进行教学！小伙伴们选择适合自己的就行。一、火山图火山图展示的是差异分子的显著性（P火山图的优点是直观待筛的展示分子的整体差异变化结果。但是不能展示每个样本

山茶

花朵直径达5—11厘米，有的可达14厘米,有单瓣和重瓣两个类型。单瓣的花后结实，重瓣的大都不结实。花的颜色有深红、粉红、白、紫等，还有花色淡雅、花芯似翠如珠的芙蓉型；底色艳红、上洒白色线条或斑点的放射型；姹紫嫣红、风韵别致的皇冠型；红条白底玲珑俏丽的托桂型；……山茶花的品种繁多，开花时绰约多姿，艳丽绝伦，花期又长，所以广泛用于园林绿化，或作主景布置，或与其他观赏植物搭配组合布置点缀于公园、名胜风景区以及庭院。 山茶不仅有很高的观赏

不用学 R 语言，十分钟也能绘制出漂亮的火山图！

，我就用自己的数据来做示范）。作图前，我们先有点预期，了解一下火山图该有的模样（大致如下，我们就拿它当模板吧）既然要做图就要有参数。瞅一眼横纵坐标，心中了然，要做图需要两个参数：差倍数及 P 值（或 FDR，或 Padj 值）。在 RNA-Seq 的数据表格中拎出这两组参数（另外，请把 genename 也一道拎出来，后续有用）1. 作图前的数据预处理在做火山图前，需要将所获得的基因表达的表格中对应的 P 值及差倍变化（FC，fold change）换算成」-log10P」和「log2FC」。然后将基因