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- 供应商:
北京普凯瑞生物科技有限公司
- 规格:
400ng/ml
为了对cfDNA测序所有工作流进行质控,以降低不恰当的操作带来的假阴性或阳性的风险,Horizon研发了这款人工合成血浆形式的cfDNA标准品--Multiplex I cfDNA Reference Standard Set in Synthetic Matrix,包含8个肿瘤相关基因突变,可以质控由提取开始的整个工作流程。
技术信息:
Multiplex I cfDNA Reference Standard Set in Synthetic Matrix覆盖8个经基因工程改造的单核苷酸突变位点(SNVs/SNPs),含多重突变频率,分别为5%,1%和0.1%的等位基因突变频率。每个批次的特定基因拷贝数都经过ddPCR精确定量。
涵盖基因:EGFR, KRAS, NRAS, PI3KCA
等位基因突变频率:5%, 1%, 0.1% 和 0% (100% 野生型)
缓冲液:合成血浆
预期DNA产出量:≥120 ng DNA (QIAamp® Circulating Nucleic Acid Kit提取)
片段大小:170bp
产品规格:400ng/ml (共4管)
验证过的突变基因:
| 100% Multiplex I 野生型 cfDNA 参考标准品 (组份货号: HD815) | |||
| 染色体 | 基因 | 突变类型 | 预期等位基因突变频率 % |
| 7p12 | EGFR | L858R | 0.00% |
| 7p12 | EGFR | ΔE746 - A750 | 0.00% |
| 7p12 | EGFR | T790M | 0.00% |
| 7p12 | EGFR | V769 - D770insASV | 0.00% |
| 12p12.1 | KRAS | G12D | 0.00% |
| 1p13.2 | NRAS | Q61K | 0.00% |
| 1p13.2 | NRAS | A59T | 0.00% |
| 3q26.3 | PIK3CA | E545K | 0.00% |
| 5% 等位基因突变频率Multiplex I cfDNA 参考标准品 (组份货号: HD812) | |||
| 染色体 | 基因 | 突变类型 | 预期等位基因突变频率 % |
| 7p12 | EGFR | L858R | 5.0% |
| 7p12 | EGFR | ΔE746 - A750 | 5.0% |
| 7p12 | EGFR | T790M | 5.0% |
| 7p12 | EGFR | V769 - D770insASV | 5.0% |
| 12p12.1 | KRAS | G12D | 6.3% |
| 1p13.2 | NRAS | Q61K | 6.3% |
| 1p13.2 | NRAS | A59T | 6.3% |
| 3q26.3 | PIK3CA | E545K | 6.3% |
| 1% 等位基因突变频率Multiplex I cfDNA 参考标准品 (组份货号: HD813) | |||
| 染色体 | 基因 | 突变类型 | 预期等位基因突变频率 % |
| 7p12 | EGFR | L858R | 1.0% |
| 7p12 | EGFR | ΔE746 - A750 | 1.0% |
| 7p12 | EGFR | T790M | 1.0% |
| 7p12 | EGFR | V769 - D770insASV | 1.0% |
| 12p12.1 | KRAS | G12D | 1.3% |
| 1p13.2 | NRAS | Q61K | 1.3% |
| 1p13.2 | NRAS | A59T | 1.3% |
| 3q26.3 | PIK3CA | E545K | 1.3% |
| 0.1% 等位基因突变频率 Multiplex I cfDNA 参考标准品 (组份货号: HD814) | |||
| 染色体 | 基因 | 突变类型 | 预期等位基因突变频率 % |
| 7p12 | EGFR | L858R | 0.10% |
| 7p12 | EGFR | ΔE746 - A750 | 0.10% |
| 7p12 | EGFR | T790M | 0.10% |
| 7p12 | EGFR | V769 - D770insASV | 0.10% |
| 12p12.1 | KRAS | G12D | 0.13% |
| 1p13.2 | NRAS | Q61K | 0.13% |
| 1p13.2 | NRAS | A59T | 0.13% |
| 3q26.3 | PIK3CA | E545K | 0.13% |
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文献和实验性由两个人工合成的引物序列决定。反应分三步: A.变性:通过加热使 DNA 双螺旋的氢键断裂,形成单链 DNA; B.退火:将反应混合液冷却至某一温度,使引物与模板结合。 C.延伸:在 DNA 聚合酶和 dNTPs 及 Mg2+存在下,退火引物沿 5‘ —— 3’ 方向延伸。 以上三步为一个循环,如此反复。 3. 逆转录酶和 RT-PCR 逆转录酶(reverse transcriptase)是存在于 RNA 病毒体内的依赖 RNA 的 DNA 聚合酶,至少具有以下三种活性: (1)依赖 RNA
上佳的上样缓冲液中,可产生相等或预期强度的条带,并且不含有条带污点,无染色阴影。与此相反,分子量标准 #1 采用较老技术制造,并存在于次优组分的缓冲液中。 b. 样品和标准品准备 须计算上样到凝胶中的 DNA 量,以确保目的条带良好分离,并用于可视化和检测。虽然用荧光染料足以检测 1 - 100 ng/条带的 DNA,但最小可检测量取决于 所用染料(了解更多: 核酸染色特性)[2]。注意,样品或标准品的超载会造成条带污点并遮盖附近条带,从而导致条带分辨不清,特别是片段大小相似时(图 2A)。 图
叶绿体 chloroplast 存在于藻类和绿色植物中的色素体之一,光合作用的生化过程在其中进行。因为叶绿体除含黄色的胡萝卜素外,还含有大量的叶绿素,所以看上去是绿色的。褐藻和红藻的叶绿体除含叶绿素外还含有藻黄素和藻红蛋白,看上去是褐色或红色 [有人分别称为褐色体( phacaplost)、红色体 rhodoplast]。许多植物的叶绿体是直径 5微米左右,厚 2— 3微米的凸透镜形状,但低等植物中则含有板状、网眼状、螺旋形、星形、杯形等非常大的叶绿体。叶肉细胞中含的叶绿体
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