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- 提供商:
合研生物
- 服务名称:
基因标志物分析
武汉合研生物医药科技有限公司坐落于光谷生物城,是一家专注于提供新药发现阶段的技术服务,以中小微新药研发企业为服务主体的创新型公司。合研生物拥有一支训练有素的药物研发技术团队,提供的服务覆盖虚拟筛选、酶学靶点筛选、抗肿瘤药物活性评价、细胞功能学检测、药理病理学服务等各项技术。我们的技术团队在分子生物学、细胞生物学、结构生物学等领域具有丰富的经验,通过酶水平、细胞水平测定等技术平台帮助客户进行化合物筛选及化合物特性、作用机制等研究。合研生物以高效、高性价比的专业服务帮助客户更快地达到目标,帮助客户推进药物发现的进程。
我们的服务
合研生物以基因芯片分析、甲基化检测、SNP基因分型、RT-PCR检测等技术为依托进行基于基因为标志物为进行的各项分析。
基因芯片分析
合研生物的基因芯片分析平台利用美国SABiosciences公司(现QIAGEN公司)开发的第二代功能分类基因芯片(Real-time PCR芯片)进行高通量的基因标志物分析。这种芯片结合了实时荧光定量PCR的优点,可在一次实验中准确定量检测上百个基因的mRNA水平,将基因芯片的检测精度提高到与实时荧光定量PCR相当的水平。本平台利用平台QIAGEN的miScript miRNA PCR Array进行miRNA的高通量检测,可以一次分析多个样本的miRNA或分析少量样本的多个miRNA水平。
DNA甲基化分析
DNA甲基化是表观遗传学(Epigenectics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印迹、胚胎发育及人类肿瘤发生中起着重要作用。合研生物提供DNA甲基化检测,主要有BSP和MSP两种方法。
● BSP法甲基化检测
用盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,这种方法称为BSP-克隆测序法。
● MSP甲基化检测
用盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。
SNP基因分型
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性。SNP在群体遗传学研究和疾病相关基因研究,药物基因组学,分子诊断和生物医学研究中起着重要作用。
我们提供的SNP分型服务,采取直接测序法,Taqman探针和质谱三种方法。
●直接测序法
在所有SNP的检测方法中,对待检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法,也是SNP分析的金标准。
技术特点:信息量大,能发现未知SNP位点;辅助疾病的诊断
●Taqman探针法(定量PCR)
设计与SNP位点互补的荧光探针
适合位点数少,高效快速自动判定SNP位点信息;
●质谱法
精确测量PCR产物的分子量,就可以知道SNP位点上的碱基A/C/G/T
技术特点:灵敏度高、误差机率低、操作简单,反应快
| 药物作用机理 | ||||
| F001 | 基因标志物分析 | PCR array | 384孔板, 客户提供样品或项目中的细胞、组织样品 | 咨询 |
| F002 | 基因标志物分析 | qPCR-mRNA | 根据客户需要,从样品中提取RNA,逆转录成cDNA,Real-time PCR的服务 | 1-2周 |
| F003 | 基因标志物分析 | qPCR-miRNA | 根据客户需要,从样品中提取miRNA,逆转录成cDNA,Real-time PCR的服务 | 1-2周 |
| F004 | 基因标志物分析 | SNP(直接测序法) | 普通测序仪3730XL | 1-2周 |
| F005 | 基因标志物分析 | SNP(Taqman探针法) | 荧光定量PCR | 1-2周 |
| F006 | 基因标志物分析 | SNP(质谱法) | Sequenom质谱仪 | 1-2周 |
| F007 | 基因标志物分析 | DNA甲基化分析(BSP) | -- | 2-4周 |
| F008 | 基因标志物分析 | DNA甲基化分析(MSP) | -- | 2-4周 |
| F009 | 蛋白标志物分析 | ELISA | 客户提供试剂盒或我方提供试剂盒及完成测试 | 咨询 |
| F010 | 蛋白标志物分析 | Western blot | 包含蛋白提取,定量及WB预实验和正式实验 | 2周 |
| F011 | 蛋白标志物分析 | 免疫组化 | 客户提供样品或由项目动物取材,客户提供抗体 | 1周 |
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文献和实验bingo816 芯片的结果,信息量很大,而且表达谱很复杂,哪位仁兄有没有什么关于分析基因芯片结果的好方法啊。 非常感谢!!! freecell http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19763933 bingo816 非常感谢您,能不能 上传一下 文章Bioinformatics analysis of microarray data
在过去的几年中,许多生物的基因组完成了测序工作,如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用,正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具,已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取,那些基于表达序列同源范围的程序,在基因组注释中的作用日益显著。即使在稀少基因或组织特异性表达的基因中,基因组序列的相关性信息也颇具参考价值。所以利用基因组序列的比对来扩充基因的信息是不可获缺的。特别是在对人类基因组做
介绍TCGA 是癌症基因组分析中相当流行的数据库,针对里面数据的挖掘结果、软件工具发表了许多 CNS 文章,不过现在已经被整合进 GDC 数据平台了。虽然现在测序技术发展的很快,单个样本测序成本比较之前而言低了很多,但是对于单个课题组研究而言,对大量样本的测序成本还是有些难以承受。TCGA 的数据集提供了一个很好的平台,我们既可以分析它衍生新的课题,也可以通过它为自己分析的结果佐证。今天的分析用的就是 TCGA 肺腺癌的数据集(TCGA-LUAD),可以点击这里进入 UCSC 的数据









