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- 2026年01月15日
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文献和实验1. Inoculate the entire colony in 5 ml YPD culture O.N. or 12 hours 2. Dilute into YPA medium (1% yeast extract, 2% Bacto-peptone, 2%KOAC) to OD600~ 0.2, Vigorous shaking. 3. For ts mutants, ~15hours at 23C, others ~10 hours at 30C
。该算法首先分析实验组中锚定位置处的氨基酸频率 FreqAAanchor。例如，锚定的磷酸化位点的实验序列具有 FreqAASer = 70％，FreqAAThr = 30％。算法从 FASTA 中随机读取 n 个蛋白质序列。在每个蛋白质序列中，锚定位点附近区域肽的长度（l）等于实验序列中的氨基酸数。在本例中，0.70 x n 个区域肽具有 Ser 锚点，0.30 x n 个区域肽具有 Thr 锚点。然后将氨基酸加入到锚定位点周围的氨基酸计数器中。当这些计数器中加入了 n 个区域肽及其氨基酸时，计算
实验时间 | 精确探索功能蛋白质氨基酸序列，这个小软件不可少
。该算法首先分析实验组中锚定位置处的氨基酸频率 FreqAAanchor。例如，锚定的磷酸化位点的实验序列具有 FreqAASer = 70％，FreqAAThr = 30％。算法从 FASTA 中随机读取 n 个蛋白质序列。在每个蛋白质序列中，锚定位点附近区域肽的长度（l）等于实验序列中的氨基酸数。在本例中，0.70 x n 个区域肽具有 Ser 锚点，0.30 x n 个区域肽具有 Thr 锚点。然后将氨基酸加入到锚定位点周围的氨基酸计数器中。当这些计数器中加入了 n 个区域肽及其氨基酸时，计算
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