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文献和实验Nature Genetics:王艇团队从转座子中发现泛癌症新抗原
析 TETs 在 GTEx 中 11686 个正常组织样本中的表达,筛选出 2297 个癌细胞特异的 TE-基因嵌合转录本(tumor-specific TE-gene chimeric transcripts,TS-TETs)。在 TCGA 分析的所有 10357 个肿瘤中,93.6% 的肿瘤至少表达了一个 TS-TET。此外,其中一些 TS-TETs 是高度普遍的,例如 L1P2_STK31 存在于 1576 个肿瘤样本中。这些转录本中有 1068 个被预测能编码嵌合蛋白或移码突变蛋白(tumor
主要分为两大类,第一类是 PKH67(绿色荧光)/PKH26(红色荧光),由于它们可以与外泌体的脂质双层膜稳定结合,所以染色效果较好,应用较广泛。 图1 PKH67 标记的外泌体与神经元之间相互作用 Acta Neuropathol Commun. 2018 Feb 15;6(1):10. 图2 PKH26 标记的外泌体与 MDA‐MB‐231 细胞共培养 Cancer Sci. 2019 Oct;110(10):3173-3182. 第二类是 Di 系列的亲脂性染料,包括DiI(橙色荧
Buffer G2,最大速漩涡10-30s,充分重悬核酸沉淀物(时间要控制得很严格)。(10)加入25μl QIAGEN Protease,50℃保育30-60min(如有必要可延长保育时间)。2)DNA的提取二、基因组步行法扩增5’及3’侧翼序列1 材料基因组DNA2.仪器、用具 离心机、PCR仪 3.试剂 (1)30μl DraⅠ(10units/μl) (2)10μl T4 DNA Ligase (6units/μl) (3)10×Ligation Buffer (4)BD Genome
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