从福尔马林固定、石蜡包埋的组织切片中进行miRNA和总RNA

FFPE 样本前处理过程及注意事项

患者活检或手术标本的研究对于阐明疾病尤其肿瘤的发病机制、指导治疗方案来说非常重要。但是活体组织一旦离体，血氧供应停止，就会产生一系列生物化学和组织形态学的改变，直至发生自溶，干缩，腐败，核酸和蛋白也会迅速降解，因此需要及时固定。福尔马林固定、石蜡包埋 (Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded, FFPE) 技术能够在组织离体后最大程度地保存其原有的形态学结构及生物学信息，成为肿瘤研究领域中疾病诊断和科学研究中非常常见的生物学材料。 在分子病理学高速发展的今天

文献速递：Nature子刊发文揭示少量癌症 DNA 的突变检测新方法。

者们提出了一种基于对双酶消化产生的基因组区域的可重复随机子集进行测序，并随后对DNA样本进行片段大小选择的测序方案。在检测到的突变类型没有偏差的情况下，实现了体细胞突变检测的充分覆盖。将这种方案称为 mutREAD，用于检测少量 DNA（包括降解样本）的突变特征。研究表明，mutREAD 概括了全基因组测序识别的突变特征，最终将允许在更大的队列中研究突变特征，此外该测序方案对福尔马林固定石蜡包埋样本也具有很好的兼容性，能够在临床中发挥重要作用。   mutREAD中各步骤的示意图。( SB，样本

miRNA表达谱--肿瘤的生物标记物

。与蛋白编码基因谱相比，用miRNA表达模式来划分癌症类型的可靠性出乎意料(Lu et al.，2005；Rosenfeld et al.，2008)。此外，在常规收集的、福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的临床组织标本中，miRNAs的表达具有特异性和稳定性，更进一步证明其作为诊断性生物标记的巨大潜能(Li et al., 2007)。在哺乳动物基因组中，约有70%的miRNA基因定位于特定转录单位。他们经常存在于蛋白编码基因的内含子处，并且优先排列在与其具有相同靶mRNA的结构处(Kim