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泽叶生物
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文献和实验Novoprotein CUT&Tag 2.0原理与应用培训
为了克服ChIP-Seq的缺陷,近岸蛋白质开发了ChiTag酶和CUT&Tag技术。CUT&Tag是一种革命性的新技术,它不需要甲醛交联和免疫共沉淀,即可特异性的将目的蛋白附近的DNA片段直接连上接头并打断,进行高通量测序。该方法可一管式高通量应用,或在单细胞研究中使用。该方法使用了ChiTag酶,可以在打断基因组的同时加上接头,不需要繁琐的补平加A加接头,并且可在一天内完成从细胞到测序文库制备全流程。
RNA干扰 RNA干扰(RNA interference,缩写为RNAi)是指一种分子生物学上由双链RNA诱发的基因沉默现象,其机制是通过阻碍特定基因的翻译或转录来抑制基因表达。当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA时,该mRNA发生降解而导致基因表达沉默。RNAi在基因沉默(silent gene)方面具有高效性和简单性,所以是基因功能研究的重要工具。 siRNA是一类长约21~25 个核苷酸的双链小RNA分子,可作为一种特殊引物,在RNA 依赖RNA聚合
相关专题 慢病毒包装技术专题 RNA干扰靶序列设计的方法最初由Elbashir et.al 2001发表。之后由于发现了RISC与siRNA结合的偏好,设计干扰效果优秀的siRNA的成功率大大增加。我们主要采用Pei and Tuschl(N2[CG]N8[AUT]N8[AUT]N2)发表的设计原则进行设计。对初步筛选出的所有符合条件的序列进行siRNA正义和反义链自由能计算,评估对RISC的亲和力。评估通过的siRNA进一步
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