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上海希言科学仪器有限公司
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文献和实验备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
超微量外泌体蛋白质组突破用量极限和检测上限-低至200μL血浆!高达4000+ EV蛋白!
变性以及MS/MS谱图的质量(信息含量)的可变性。最终结果是,来自不同生物样本的数据集没有识别和量化同一组蛋白质;或者换句话说,DDA模式的lable-free定量蛋白质组学数据集将包含很多缺失值,并且这主要影响较低丰度的蛋白质。近年来,数据非依赖性采集(data-independent acquisition,DIA)技术出现,指定m/z范围内的所有前体离子都同时进行MS碎片化,复杂的MS2谱图与包含碎片离子谱图、前体离子精确质量及其归一化保留时间的谱图库搜库比对。DIA在增加已鉴定肽的数量、提高定量精度和增加
DDA方法进行量定量和鉴定的实验将成为首选方法。然而,从IDA到目标数据非依赖采集(Data Independent Acquisition, DIA)的直接路径(例如SRM)也正在发生变化。具有SRM分析性能的DIA方法的发展将使数据可用于测试多种假设,甚至用于不同的实验,从而减少质谱分析所需的数量,并将重点转向生物信息学问题。 什么是SRM?迄今为止发布的DIA方法仍然缺乏SRM方法的特性。尽管选择性和特异性在诸如AIF/MSE的DIA方法中受到关注,但许多问题已经在SWATH等方法中得到解决
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