启动子、增强子序列钓取

【求助】关于启动子的序列界定

zxmgugl 最近在查某个基因的启动子区CpG岛，发现一个问题： 在一个CpG finder的软件上，如果输入的是这个基因第一个外显子第一个碱基的上游序列，能反馈出一段CpG岛（虽然长度只有50多bp，这点也很奇怪，因为这个在线软件的CpG岛界定标准就是长度大于200bp）；如果输入的是这个基因第一个外显子序列内第一个出现的ATG序列的上游序列的话，软件又分析出一段除了前面那个CpG岛，一段更长的CpG岛。 所以，就有疑惑

一招搞定启动子序列查找

在研究基因转录调控的过程中，科研汪经常需要构建某个基因启动子的荧光素酶报告质粒或者预测与某基因启动子结合的转录因子，无论哪种，首先得查找到某基因的启动子序列。能查到启动子序列的网站很多，pubmed，ensemble，UCSC 等等，可是这些网站气场太强大，小白 hold 不住，看得还是很迷糊，肿么破？别担心，这里有一个界面超级友好的网站，可以快速简单的查到到启动子序列，即：The eukaryotic promoter database（EPD）真核启动子数据库EPD 是一种注释非冗余的真核

决定转基因表达的启动子序列

1. 引言 传统的观点认为真核生物基因的表达是由位于同一分子（顺式元件）上的 DNA 序列与不同 DNA 分子（反式作用信号）编码的蛋白质或 RNA 之间的相互作用来调控的。这些顺式作用元件包括 CAAT 框和 TATA 框、启动子本身的响应元件、编码区远上游或下游端的增强子元件、5' 及 3' 非编码区（UTR ) 、内含子、多聚腺苷酸信号等。然而，这个相当简单的观点一直受到怀疑，特别是随着人们对哺乳动物生物学知识了解的逐步深入，该观点也得到更新和完善。（见示例