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| 过敏性鼻炎相关PCR芯片 |
| 喉部疾病相关PCR芯片 |
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文献和实验,可以检测PCR体系中是否存在DNA污染,或者是否有影响反转录或PCR实验步骤的因素存在。 图一 PCR芯片实验流程 PCR芯片的设计和所包含的基因 96孔模式的每种RT2Profiler PCR芯片,含有基因特异性引物,可用于研究84个与某种信号通路或者疾病相关的基因。此外,芯片中还有设置了3个检测实验质量的对照。图2为PCR芯片模式图。由于每种芯片都是根据特别的信号通路或者特定的应用范围设计的,研究者可以用它来研究自己感兴趣的一组基因,一个生物学通路或者某种疾病状态。PCR芯片所研究
的低聚物有试样是否具有代表性的问题。因此,Affimetrix 制造每个基因含20碱基的芯片(每个低聚物是25-mer),而且判断相关基因的表达要经过一个统计过程以确保达到足够的DNA序列量。这样,样品DNA需要剪切到与诱饵DNA体积相当。Affiy芯片尽管照相平版术是芯片合成的代表性方法,它对芯片密度和光衍射的限制饱受批评。1999年九月期的Nature Biotechnology上,威斯康辛大学Madison分校的Michael Sussman博士团队的科学家引入了一个不要掩膜而使用数码照相
经RT-PCR进行定量后,可作为胸膜间皮瘤诊断的标记物(Markers)。Sgroi报告DNA芯片结合激光捕获显微切割技术(laser capture microdissection)用于乳癌浸润期和转移期及正常细胞的基因表达谱(gene expression profiles)差异研究,结果被定量PCR和免疫组化所证实。差异表达有助于早期发现瘤细胞3万个基因与正常细胞的区别,有助于了解瘤细胞的发生、浸润、转移和药敏。最近,美国毒物化学研究所(CIIT) 和国家环境健康科学研究所(NIEHS)正计划
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