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代谢组学服务UPLC--
代谢组学服务UPLC---Q-TOF LC/MS,靶向代谢组
西农生(北京)生物技术有限公司
代谢组学服务UPLC---Q-TOF LC/MS 声明:为保护客户的权益与保密协议,在保证实验结果真实有效的前提下,我们对实验的数据进行了适当的变动处理,简化了实验流程及采样数量。请勿转载!责任自负! 使用仪器:液-质联用UPLC-----Agilent 1290
样品信息:患病组血清样品vs.对照组血清样品 实验流程:通过UPLC----Q-TOF LC/MS分析,分析患病组和对照组血清样品代谢成分,获得代谢组分的实验数据。利用数学分析方法寻找患病组和对照组中具有差异性的代谢组分,建立未知样本分析模型。 实验步骤: 一、采样对样本来源进行分组,并记录性别、年龄、病情、治疗等信息;采集全血,离心后获得血浆/清样本,于-80℃冰箱中保存。血浆/清样本用提取液沉淀蛋白,并于-20℃下提取化合物1 h;高速离心后取上清液,经真空抽干后复溶于甲醇溶液。二、仪器分析及数据预处理(信息峰的提取和识别)图一 人血清样品典型的LC/MS总离子流图(TIC, ESI+,m/z 60–1000.)三、数据分析 图二:主成分(PCA)得分图:每个点代表一个样本,对照组和患病组样本在CA空间可以明显的分为两组 图三: 偏最小二乘法判别分析(3D PLS-DA,S-Plot),寻找候选生物标志物,可用于疾病诊断和模型识别四、差异代谢物鉴定图四:高分辨率MS/MS鉴定,右图是左图(一级质谱结果)单峰的二级质谱结果 另:生物信息学服务内容:后期数据分析及挖掘 A、疾病识别,诊断模型 B、系统生物学分析图五:疾病潜在生物标志物的代谢通路分析,阐释发病机制和生命现象 靶向代谢组:小分子化合物定量分析运用LC-MS/MS、HPLC、GC-MS对样品中指定小分子化合物进行定性和定量分析。
1 、AB5500 Qtrap详见公司网站
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