单细胞组学生信分析

分析目的

基于客户关注的科学问题或者我们通过文献调研、公共数据调研，确认研究方向，通过这些已发布的不同小鼠模型和人类组织的单细胞测序数据集，挖掘数据亮点，分析一整套数据，揭示细胞异质性、发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能。

数据来源

TCGA，GEO等公共数据库。

分析方法

（1）对该数据进行了细胞类群鉴定及注释，比较了不同分组各细胞类群相对比例变化；（2）基于特别关注的细胞类群，比如巨噬/单核细胞对其划分细胞亚群，分析样本中不同亚群的细胞比例及基因变化，获得了共同发生显著差异的基因。（3）接着针对巨噬/单核细胞亚群进行了转录因子调控网络分析，分析三种模型共同变化的转录因子。（4）对样本单细胞数据中巨噬/单核细胞进行亚群分析，差异基因与小鼠模型做比较，获得在样本中发生显著调控的基因。

分析内容

3-5张主图，4-5张附图，包括：细胞类群鉴定、细胞亚群细分、亚群间的基因差异表达分析、差异表达基因蛋白互作分析、亚群拟时轨迹分析、细胞通讯分析、免疫浸润分析、差异基因疾病数据库注释、预后模型构建。

分析结果示例图