- ￥200 - 4000
- 基于客户关注的科学问题或者我们通过文献调研、公共数据调研，确认研究方向，通过这些已发布的不同小鼠模型和人类组织的单细胞测序数据集，挖掘数据亮点，分析一整套数据，揭示细胞异质性、发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能。
- 湖北武汉
- 2026年05月29日
企业认证
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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商：
傲星
- 服务名称：
单细胞组学生信分析
- 规格：
项
单细胞组学生信分析
分析目的
基于客户关注的科学问题或者我们通过文献调研、公共数据调研，确认研究方向，通过这些已发布的不同小鼠模型和人类组织的单细胞测序数据集，挖掘数据亮点，分析一整套数据，揭示细胞异质性、发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能。
数据来源
TCGA，GEO等公共数据库。
分析方法
（1）对该数据进行了细胞类群鉴定及注释，比较了不同分组各细胞类群相对比例变化；（2）基于特别关注的细胞类群，比如巨噬/单核细胞对其划分细胞亚群，分析样本中不同亚群的细胞比例及基因变化，获得了共同发生显著差异的基因。（3）接着针对巨噬/单核细胞亚群进行了转录因子调控网络分析，分析三种模型共同变化的转录因子。（4）对样本单细胞数据中巨噬/单核细胞进行亚群分析，差异基因与小鼠模型做比较，获得在样本中发生显著调控的基因。
分析内容
3-5张主图，4-5张附图，包括：细胞类群鉴定、细胞亚群细分、亚群间的基因差异表达分析、差异表达基因蛋白互作分析、亚群拟时轨迹分析、细胞通讯分析、免疫浸润分析、差异基因疾病数据库注释、预后模型构建。
分析结果示例图
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文献和实验血液 CD66b+ 中性粒细胞（PMN）和胰腺癌组织 CD45+ 免疫细胞 单细胞捕获平台：BD RhapsodyTM 单细胞实验分组： HC-PMN（健康组）×2；CP-PMN（慢性胰腺炎组）×2；PDAC-PMN 细胞×5；PDAC免疫细胞×5 主要技术手段： 单细胞测序，空间转录组测序，转录组测序，蛋白组、代谢组质谱分析，免疫荧光，免疫组化，pcr（qpcr）分析 单细胞分析工具应用： 细胞聚类分析，subCluster 分析，差异基因表达分析，GO/Pathway 分析，拟时序分析
单细胞测序在疾病诊断和细胞异质性研究中发挥着重要作用。然而目前的单细胞测序手段需要将细胞消化并裂解才能够进行，而细胞状态在这一操作中不可避免的会发生改变，因此很难掌握细胞真实的基因表达情况，尤其对于基因通路上表达变化的检测为不利。近期苏伊士理工大学使用FluidFM创建了一种原位活细胞基因测序方法，这种方法能够在不杀死细胞的情况下完成对细胞的测序工作。通过这种技术该团队成功完成单细胞RNA基因测序，并通过这种方法检测到了细胞的基因表达和细胞周期状态变化。下面本文就这项工作的具体内容进行阐述
单细胞和空间组学课题研究思路及案例分析
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