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蛋白质糖基化位点鉴定
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北京普瑞华盛生物科技有限公司
- 规格:
10 ug
蛋白质糖基化:
蛋白质糖基化是目前已知的最为复杂的翻译后修饰之一,与癌症的发生密切相关,目前已知的诊断标志物都是糖基化蛋白质。
糖基化对蛋白质生物制品的功能、稳定性及其在人体中的副作用和毒性往往有重大的影响。 由于细胞生长条件的改变都可能导致一个蛋白质产品糖基化的变化。因此,在西方国家生产的蛋白质生物制品的每一批产品都需要进行糖基化的分析。
对于具有常见的比较简单的糖基化的蛋白质产品,我们的肽普图服务可以得到蛋白质的糖基化位点和主要结构。根据有关糖肽的数据,我们可以确认糖基化结构。蛋白 质生物制品所有常见的糖基化(比如G1F等) 都可以通过我们的肽谱图服务确定。我们也可以分析鉴定客户指定的糖基化形式。 从液相色谱中收集的各种糖链组分将用于和多种糖苷酶反应和LC-MS/MS分析以逐步推导出糖链的结构。
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文献和实验注:如同时要求外泌体抽提、鉴定及蛋白质组学,请将样本要求量进行加和。 备注:请明确提供的样本体积。细胞上清及尿液,超过 50ml,每 50mL 算作一个 1 个样本,以此计算样本数,核算抽提周期。血清、血浆、关节液、脑脊液进行超速离心,每 5mL 算作 1 个样本,以此计算样本数,核算抽提周期。
N-连接的糖基化是一种具有重要生物学意义的翻译后修饰过程,但是现在已经发现的糖基化蛋白并不多。作者在这里采取了一种“滤纸收集样品(filter aided sample preparation,FASP)”的方法,籍此糖基化多肽可以富集于载有凝集素的滤纸上,然后用高精确度的质谱技术从小鼠的四种组织和血浆的2352种蛋白质上发现6367个糖基化位点。其中,涵盖了Swiss-port服务器中已经试验验证的830个糖基化位点中的74%,而另外5753个糖基化位点则是第一次被发现
蛋白质鉴定工具 蛋白质鉴定意味着将实验测定的蛋白质性质和可以利用计算机手段从一个数据库得到的蛋白质性质进行比较。考虑到这些不同的性质,已经开发了一大批蛋白质鉴定工具,如氨基酸组成、序列标签或质谱衍生的数据等,所有的这些工具都是通过与蛋白质数据库中的某一个蛋白质条目提供最佳的匹配来达到鉴定蛋白质的目的。 以PMF和MS/MS为基础的蛋白质鉴定工具只能对部分实验信号进行注释或解释。当前已有的工具能够寻找肽的氨基酸序列,某些修饰应予考虑。这些修饰包括那些已知的由实验
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