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文献和实验qPCR引物设计,Primer3 Plus 和 Primerbank 都能搞定!
引物设计是 qPCR 非常重要的环节。今天小编给大家推荐 2 款简单实用的在线 qPCR 引物设计网站,让你分分钟搞定 qPCR 引物!Primer3 Plus严格的 qPCR 引物设计一般要求其中一条引物要跨外显子,最好在 3' 端设计引物,产物的长度在 300bp 以内等。本在线软件可满足 qPCR 引物设计的要求。网址链接:http://www.primer3plus.com/1、选择 Run latest Versionof Primer3Plus,就进入了设计引物的主页面,合理的使用
找的基因后,在几对引物中选择自己看着顺眼的那对拿去合成就好了。开玩笑啦,还是有选择标准的:首先看看 Amplicon Size,也就是扩增长度,建议在 100~300bp 间比较好扩增;引物长度在 20~25bp 较好,而且上下游引物间不要相差超过 5bp;再就是看看 Tm 值,60℃左右,相差不要超过 1℃。综上,将选择好的引物(这里我选择 Primer Pair 3),进一步验证,这里很友好,支持复制粘贴。5. 还是回到 Pubmed,打开里面的 primerblast。网址是:https
%,避免引物内含有互补序列,3』端尽量不要出现含有连续三个以上的 G 或 C 的片段,真核基因设计引物时最好跨内含子哦。 选择合适 ROX 参照染料 各位同学在选购产品、做实验时,首先要弄清自己实验室的仪器对应哪种 ROX(High 还是 Low)!试剂买回来,样也加好了,最后发现不能用在自家仪器上,内心也一定是很崩溃。诺唯赞的染料法荧光定量专用预混液提供各种 ROX 供选择,如果不想这么麻烦,ChamQTM Universal SYBR® qPCR Master Mix (Q711)那是极好
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