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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 规格:
50 T/盒
描述
SPF级大小鼠病原体质量控制多重qPCR联检试剂盒(国标病毒选检六项)
(探针法)
【产品规格】
SPF.M/R-OV-001 50 T/盒
【产品说明】
Biowing®SPF级大小鼠国标选检病毒qPCR联检试剂盒,采用Taqman荧光定量PCR技术,专为在多种样本类型中快速、高灵敏地筛查SPF级实验室大小鼠常见的6种病毒而设计。
本试剂盒采用一步法RT-qPCR,设计6套引物探针分别在FAM(淋巴细胞 脉络丛脑膜炎病毒LCMV(RNA)、小鼠诺如 病毒MNV(RNA)、大鼠冠状病毒RCV(DNA)),HEX(鼠痘病毒/脱脚病毒Ect(DNA)、小鼠脑脊髓炎病毒TMEV(RNA)、多瘤病毒Poly(DNA))两个通道检测6种病毒,另外一套引物探针在CY5通道检测内参RNA。该试剂盒具有以下特点:
灵敏:检测灵敏度较高,10 copies/μL可被有效检出。
高效:单管一次可检出6种病毒。
稳定:全程闭管操作,无交叉污染。
可靠:含内参对照,避免假阴性。
方便:操作简单,一步法检测。
【运输及保存条件】
低温冷冻运输,-20℃保存,有效期1年;使用后仍存放在-20℃,不可反复冻融超过三次。
【产品组分】
A BOX:
| 组分名称 | 装量 |
| Biowing®Virus qPCR Reaction Mix | 110 μL×2管 |
| Biowing®Optional Virus Primer&Probe Mix | 冻干粉×2管 |
| RNase Free Water | 1.1mL×2管 |
| 石蜡油 | 1.1mL×1管 |
B BOX:
| 组分名称 | 装量 |
| 阳性质控1(PC1) | 冻干粉×2管 |
| 阳性质控2(PC2) | 冻干粉×2管 |
| 阳性质控3(PC3) | 冻干粉×2管 |
| RNase Free Water | 1.1 mL×1管 |
注:
(1)阳性质控(PC1)包含3种病毒核酸或含特定片段的质粒DNA,分别是淋巴细胞 脉络丛脑膜炎病毒LCMV、鼠痘病毒/脱脚病毒Ect、内参RNA。
(2)阳性质控(PC2)包含3种病毒核酸或含特定片段的质粒DNA,分别是小鼠诺如 病毒MNV、小鼠脑脊髓炎病毒TMEV、内参RNA。
(3)阳性质控(PC3)包含3种病毒核酸或含病毒特定片段的质粒DNA,分别是大鼠冠状病毒RCV、多瘤病毒Poly、内参RNA。
【操作步骤】
1. 样本制备
推荐配套使用翼和SPF-Level Mouse/Rat Pathgen DNA/RNA Kit Pro(货号:PRE.M/R-001),此试剂盒提取快速,回收率较高,并提供核酸保护剂(含内部质控),可以对提取过程进行质控,若使用其他提取试剂盒需先自行测试。
2. 产品组分的复溶
A BOX:Biowing®Optional Virus Primer&Probe Mix先12,000 rpm离心5 min,按下表加入RNase Free Water,涡旋震荡1 min,瞬离5 s,室温放置5-10 min后备用。
| A BOX: | 每管需加入RNase Free Water量 |
| Biowing®Optional Virus Primer&Probe Mix | 302 μL |
| 注:A、B BOX复溶分别用盒中所给的RNase Free Water,请勿混用、复用,避免污染;产品组分复溶后建议-20℃保存,反复冻融不超过三次,可分装后储存。 | |
B BOX:阳性质控1(PC1)、阳性质控2(PC2)、阳性质控3(PC3)先12,000 rpm离心5 min,按下表加入RNase Free Water,涡旋震荡1 min,瞬离5 s,室温放置5-10 min后备用。
| B BOX: | 每管需加入RNase Free Water量 |
| 阳性质控1(PC1) | 44 μL |
| 阳性质控2(PC2) | 44 μL |
| 阳性质控3(PC3) | 44 μL |
| 注:A、B BOX复溶分别用盒中所给的RNase Free Water,请勿混用、复用,避免污染;阳性质控务必与A BOX分开保存,防止污染,复溶后立即通风并喷洒酒精,以防气溶胶污染;产品组分复溶后建议-20℃保存,反复冻融不超过三次,可分装后储存。 | |
3. qPCR 反应液的准备
(1)根据所要检测样品的数量,计算所需反应孔数,每个样本做单孔。
反应孔数=3个阳性质控+1个阴性质控+样本数
(2)根据反应孔数计算所需的Biowing®Virus Probe qPCR Mix总量(需有1孔的加样损失量):
Biowing®Virus Probe qPCR Mix=(反应孔数+1)×15 μL
(3)各试剂放室温融化,并非根据下表所示准备qPCR mix:
| 组分/样品管 | Biowing®Virus qPCR Reaction Mix (µL) | Biowing®Optional Virus Primer&Probe Mix
(µL) |
总体积
(µL) |
| 1孔 | 4 | 11 | 15 |
| N孔
(反应孔数+1) |
4N | 11N | 15N |
4. qPCR 反应体系及反应条件
(1)震荡混匀Biowing®Virus Probe qPCR Mix,低速离心,将管盖残留液体收集至管底。
(2)向每孔反应管中分装15 μL qPCR Mix。
(3)向已分装过qPCR Mix的反应管中加入15 μL石蜡油。
(4)向反应管中加入样品,3,000 rpm 瞬离5 s,加样示例如下:
| 组分/样品管 | 待测样品管
(µL) |
阳性对照管1
(µL) |
阳性对照管2
(µL) |
阳性对照管3
(µL) |
阴性对照管
(µL) |
| Biowing®Virus Probe qPCR Mix | 15 | 15 | 15 | 15 | 15 |
| RNase Free Water | 0 | 0 | 0 | 0 | 5 |
| Sample | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 阳性质控1(PC1) | 0 | 5 | 0 | 0 | 0 |
| 阳性质控2(PC2) | 0 | 0 | 5 | 0 | 0 |
| 阳性质控3(PC3) | 0 | 0 | 0 | 5 | 0 |
PCR仪设置以宏石SLAN-96S为例,先新建并保存程序项目,选择定性/绝对定量模式,反应体系20 µL,选择FAM、HEX、CY5通道,按照下表设置程序进行保存:
| 步骤 | 循环数 | 温度 | 时间 | |
| 1 | 逆转录 | 1 | 55℃ | 15 min |
| 2 | 预变性 | 1 | 95℃ | 30 s |
| 3 | 变性 | 40 | 95℃ | 10 s |
| 退火与延伸 | 60℃ | 30 s | ||
| 60℃延伸时收集荧光信号 | ||||
| 通道选择:样本检测通道-FAM、HEX;内参检测通道-CY5。宏石SLAN-96S荧光定量 PCR 仪不需 ROX 校准。若存在部分荧光定量PCR仪无CY5通道,即不分析该通道。 | ||||
注:反应热程序DNA/RNA皆适用。
【阈值设置】
以宏石SLAN-96S为例,常用选项中扩增曲线算法选择相对荧光值法-log,基线设置3-15个循环。
(1)按照机器的自动阈值或者手动调整阈值线将阳性质控(PC)各通道的Ct值定为≤32,根据该阈值线进行检测样本结果的判定。
【结果判读】
以宏石SLAN-96S为例,根据样本(FAM/HEX)Ct值判定是否发生病原菌感染,具体标准如下:
| PCR模板 | 样本(FAM/HEX) | 判定说明 |
| 阳性对照
(1、2、3) |
≤32 | 阳性成立 |
| >32 | 阳性不成立 | |
| 待测样品 | >40 | 阴性成立 |
| ≤40 | 阳性成立 |
注:
- 样本阳性判断标准为:
(1)样本Ct值≤40时,判定为阳性。其中FAM通道Ct值≤40,样本可能感染淋巴细胞 脉络丛脑膜炎病毒LCMV、小鼠诺如 病毒MNV、大鼠冠状病毒RCV中的一种或几种;HEX通道Ct值≤40,样本可能感染鼠痘病毒/脱脚病毒Ect、小鼠脑脊髓炎病毒TMEV、多瘤病毒Poly中的一种或几种。
(2)不同机器的检测灵敏度不同,不同样本类型性质不同,建议使用该系列试剂盒检测样本前,利用SPF样本进行适应性验证后制定阳性判断标准。
- 若各通道有阳性出现,建议进一步使用鉴定试剂盒进行单一病原体感染确认:
(1)FAM通道阳性:使用SPF.M/R-OVF-004试剂盒,对三种可能感染的病毒(淋巴细胞 脉络丛脑膜炎病毒LCMV、小鼠诺如 病毒MNV、大鼠冠状病毒RCV)进行确认。
(2)HEX通道阳性:使用SPF.M/R-OVH-005试剂盒,对三种可能感染的病毒鼠痘病毒/脱脚病毒Ect、小鼠脑脊髓炎病毒TMEV、多瘤病毒Poly进行确认。
- 检查内参通道扩增是否正常,内参扩增不正常,表明核酸抽提过程有误或者PCR反应未正常进行,需重复检测。
【注意事项】
由于PCR反应非常灵敏,实验操作中应注意以下事项,以免发生核酸污染。
- 建议分区操作
(1)A区:(洁净区)配制Mix和qPCR阴性加样,建议在超净工作台完成,并配套干净器具及无菌无酶耗材专用于体系配制。
(2)B区:(核酸提取及加样区)样本DNA/RNA提取,建议在超净工作台完成,若无超净工作台请通风状态下提取并立即消杀,需配套专用于核酸提取的器具,并在每次提取后对环境和器具进行核酸消杀处理;加样区,按照先加待测样本,后加阳性对照的顺序加样,在qPCR反应板上阳性对照的排布应远离待测样本孔和阴性对照;同样需配套专用于加样的仪器,并在每次加完样后进行核酸消杀处理。
(3)C区:(核酸扩增区)此区域放置荧光定量PCR仪及相关电脑进行数据处理,同样需定期进行核酸消杀。
- 其他
(1)由于B BOX含阳性质控,为避免试剂受到核酸污染,A、B BOX请分开储存。
(2)每个组分在使用前都应先低速离心后小心开启。使用时请上下轻柔颠倒十次混匀,避免起泡,并低速短暂离心后使用。
(3)qPCR反应板封膜或盖盖子时需反复压紧。
(4)上机扩增前,反应管短时低速离心,将管壁液体收集至管底。
(5)盖上反应管盖子或者贴上光学膜后,为避免影响荧光信号读取,请注意不要在管盖或者膜上做标记,或者用刮板反复摩擦。
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文献和实验中是否含有逆转录/扩增抑制剂(图 2)。 表 1:阳性内对照和相关试剂盒 图 2:通过 IPC 提示体系中抑制剂的存在。实验结果为同样浓度的 RNA 加入相同拷贝 Xeno IPC,在不同浓度的扩增抑制剂血红素存在下(0-4μM),Xeno IPC 的 Ct 值与目标 RNA 的 Ct 值定量结果。 阳性样本对照 Positive Sample Control 阳性内对照虽然可以在一定程度上反应核酸提取效率,但是却很难反馈提取流程中对核酸释放的效率。一些病原体的样本,尤其是含有革兰
微生物,或对有多个型别的目的基因进行分型,特别是用一滴血就可检测多种病原体. ②系统性,多重PCR很适宜于成组病原体的检测,如肝炎病毒,肠道致病性细菌,性病,无芽胞厌氧菌,战伤感染细菌及细菌战剂的同时侦检. ③经济简便性,多种病原体在同一反应管内同时检出,将大大的节省时间,节省试剂,节约经费开支,为临床提供更多更准确的诊断信息. 生物试剂库: 试剂库 :http://www.bioon.com.cn
1.确定被检物体采用什么标准检测 我国现行检测标准(国标GB、部标JB、行标HB)、以及国际标准ISO或美标ASMI等等。 2.确定采用什么方法检测 a)有损(取被检物品部分或使其变形的检测方法,检测精度高;检测速度慢):化学分析、物理试验。 b)无损(对被检物品无损伤的检测方法,检测精度相对低;检测速度快):射线、声波、电磁、渗透、镜相。 3.传感器选择 传感器:把要检测的量转换成我们能够显示、计算或能输入到其他机器的部件,检测精度主要取决
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