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靶蛋白是什么
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靶蛋白是什么
靶蛋白(Target Protein)是指在生物医学研究和药物开发过程中被特异性识别、调控或修饰的功能性dànbáizhì分子。作为细胞信号传导、代谢调控和疾病发生的关键执行者,靶蛋白的鉴定与功能研究是现代分子生物学、结构生物学和药物设计的核心内容。从广义上看,靶蛋白可以是任何与特定生理或病理过程相关的dànbáizhì,例如激酶、受体、离子通道、转录因子或酶类;从狭义上看,靶蛋白特指在药物开发中被选作干预对象的dànbáizhì,其结构或功能异常可能导致疾病,而通过小分子化合物、抗体或核酸药物对其进行调控可能产生治疗效果。
在分子机制层面,靶蛋白的功能通常通过与其他生物分子(如配体、底物、DNA/RNA或其他dànbáizhì)的相互作用实现。例如,G蛋白偶联受体(GPCRs)作为重要的靶蛋白家族,通过结合 extracellular ligands 触发细胞内信号级联反应;而激酶类靶蛋白(如EGFR、BRAF)则通过磷酸化修饰下游底物调控细胞增殖与存活。对靶蛋白的深入研究依赖于多种技术手段,包括X射线晶体学、冷冻电镜(cryo-EM)解析其三维结构,表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)测定结合亲和力,以及基因编辑技术(如CRISPR-Cas9)验证其功能。
在药物研发中,靶蛋白的筛选与验证是临床前研究的核心环节。通过高通量筛选(HTS)或虚拟筛选(Virtual Screening)从化合物库中识别潜在靶蛋白抑制剂,再结合细胞与动物模型评估其药理活性。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。近年来,PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体)等新兴技术进一步扩展了靶蛋白的干预策略,通过诱导靶蛋白的泛素化降解实现更长效的调控效果。
靶蛋白的选择需综合考虑其疾病关联性、成药性(Druggability)以及生物标记物的可检测性。例如,在肿瘤治疗中,针对PD-1/PD-L1免疫检查点靶蛋白的抗体药物显著改善了癌症患者的生存率;而在神经退行性疾病领域,β-淀粉样蛋白(Aβ)和Tau蛋白作为阿尔茨海默病的经典靶蛋白,其药物开发仍面临重大挑战。
常见问题:
Q1. 如何评估一个dànbáizhì是否适合作为药物开发的靶蛋白?
A:评估需基于三个核心标准:1)明确的疾病关联性,需有遗传学或病理学证据支持其功能异常与疾病直接相关;2)可干预性,即靶蛋白具有可被小分子或生物大药物结合的活性位点或变构位点;3)安全性,靶蛋白的抑制或激活不会导致不可接受的脱靶效应或毒性。
Q2. 为什么部分靶蛋白在体外实验中表现良好,却在临床试验中失败?
A:可能原因包括:1)靶蛋白在人体内的调控网络比体外模型更复杂,存在代偿机制;2)药物未能达到靶组织有效浓度(如血脑屏障限制);3)靶蛋白的功能存在物种差异性,动物模型结果无法wánquán预测人体反应;4)靶蛋白可能具有未知的生理功能,干预后引发意外副作用。
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文献和实验近年来外泌体是一个比较热的研究点,本节课介绍了外泌体的项目情况、胞外囊泡、Evs理化特征、外泌体组分、外泌体功能等知识点。
BATMAN-TCM、STITCH、SwissTargetPrediction 这三个工具都能预测靶蛋白及功能!
不少研究中药或者小分子药物的同学想从研究的分子出发预测靶蛋白和相关的功能(比如信号通路),今天我们就来介绍三个工具。1. BATMAN-TCM网站链接:http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/这个网站我们以前介绍过,这里再简单说一下使用方法:以三七为例,第一步输入三七的拼音:san qi,第二步是确定参数:最后单击 Start 就可以了:等一下以后就出来结果了:2. STITCH网站链接:http://stitch.embl.de/ STRING 大家都用过
Western Blot实验可以说是生物专业最基础的实验了,然而,虽然WB实验天天做,但是正常高清的结果图并不是你想有就能有。 WB 实验出现最多问题的,应该就是各种背景问题了。 你想一下,好不容易实验过五关斩六将做到最后一步,扫描结果出了,是这样的: 为什么明明跑出了想要的趋势,但就是背景脏?怎么让自己的条带不因脏脏的背景而毁了呢? 这里要清楚一点,背景脏不一定是因为仪器不干净造成的,也有可能是蛋白降解或者整个实验过程中条件不合适造成的,有可能是以下的环节出了问题
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