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上海维亦特生物
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文献和实验。 常规思路:影响因子≤5分的文章研究思路 这一梯度的文章思路相对简单,主要是依靠代谢组学自身数据进行分析与挖掘。文章通过寻找不同组之间的代谢物并筛选差异明显的部分,最终找到了与某类疾病有关的代谢物以及它们所在的通路。研究分析思路见下: 研究思路文章参考: 中文标题:Fraxinellone 通过氧化应激和转运途径诱导斑马鱼的肝毒性 研究对象:斑马鱼 发表期刊:molecules 影响因子:4.411 发表时间:2022 年 4 月 合作单位:中国医学科学院北京
Nature:陈玲玲团队发现核仁新结构调控核糖体 RNA 末端加工重要机制
,进而激活 RNA 稳态监控系统(RNA Exosome)在核仁发挥活性,引发异常 pre-rRNA 的降解,导致成熟的 28S rRNA 减少,无法维持细胞内核糖体的稳态和蛋白质合成,因此造成斑马鱼和小鼠的早期发育缺陷,甚至死亡。 PDFC 蛋白质 URB1 调控 pre-rRNA 生成及胚胎发育。a.12 个 PDFC 蛋白质的超高分辨率细胞成像 b.Urb1 敲除导致斑马鱼颅骨发育异常 c.URB1 缺失导致 3' ETS 异常保留的 pre-rRNA 在核仁内累积 d.URB1 缺失激活
了50条连锁群,上图标记5885,标记平均距离0.68 cM。将得到的连锁群与鲤鱼的近缘物种斑马鱼进行比较基因组学研究,结果显示鲤鱼的2条连锁群对应斑马鱼的1条染色体,二者的共线性良好,说明高质量的SLAF分型结果。 SLAF-seq技术为大规模基因分型提供了一个高通量的策略,并且能应用于不同物种和群体,适用性非常广。SLAF标记的质量评估部分的基本原理,采用基因分型质量评分对标记质量进行评估。质量评分采用PHRED 公式的算法,错误率数据用新的方法得到。文章中,对于SLAF简化效率的评估方式
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