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文献和实验(IF 28) 揭秘黑色素瘤细胞新状态!剑桥大学癌症研究中心最新合作文章揭示强大的基因表达程序是状态转变的基础
,regulon在不同细胞中的活性不同 文章中,基于特定基因,KEGG通路确定10个细胞系的三种状态后,作者利用SCENIC挖掘了影响细胞状态的regulon(图3 a),并构架了对应的GRN(图3 b)。结果表明,melanocytic状态具有高活性的SOX10, TFAP2A, MITF, IRF4, HES6和SOX4,其中SOX10和MITF是黑色素细胞系特异性(melanocyte-lineage-specific)TFs;mesenchymal-like状态下,JUN, SOX9
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3. PTFG 序列是 TRIM25 与 G3BP1 形成共相分离所必需的。 (A) 转染 poly(I:C) 后 G3BP1(绿色)和 TRIM25 WT 或 ∆PTFG(红色)点状颗粒形成的延时显微照片,以及转染后 6 小时或 10 小时斑点的放大图像。比例尺:10 µm。插图:白色框内区域的放大图;(B) TRIM25 的 PTFG 基序是与 HeLa 细胞中的 G3BP1 共定位所必需的。细胞转染了 GFP-TRIM25 ∆PTFG 而不是 TRIM25 WT。比例尺:10 μm。 最后,研究
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