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99
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北京诺博莱德科技有限公司
Zero-Blunt Simple Quick Ligation Kit
pZERO-Blunt Simple零背景平末端快速连接试剂盒
(不含MCS)
目录号:42113
试剂盒组成、储存、稳定性:
|
试剂盒组成 |
20次(42113-20) |
40次(42113-40) |
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pZERO-Blunt Simple Vector(40ng/ml) |
20 ml |
40 ml |
|
1K bp Control(40ng/ml) |
5 ml |
5 ml |
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2 ´ Quick Ligation Buffer |
100 ml |
200 ml |
|
T4 DNA ligase, 5U/ml |
20 ml |
40 ml |
|
pZERO-Blunt Simple Forward Sequencing Primer (10µM) |
100 ml |
200 ml |
|
pZERO/Blunt Simple Reverse Sequencing Primer (10µM) |
100 ml |
200 ml |
-20℃储存,6个月内不影响使用效果。
产品介绍:
零背景平末端快速连接试剂盒是一种先进的自杀基因阳性选择克隆系统,可以高效克隆平末端 PCR 产物和任何具有平末端的DNA 片段。该试剂盒对磷酸化或非磷酸化的 DNA 片段都有效。 阳性选择载体和插入片段连接仅需 5 分钟即可获得超过 90%的阳性重组克隆。由具有校正活性的聚合酶(如:Pfu polymerase)扩增的平末端 PCR 产物可直接连入克隆载体。连接产物可直接转化常用的大肠杆菌菌株。
试剂盒提供一个新颖的自杀基因阳性选择克隆载体pZERO-Blunt Simple。该载体含有致死的自杀基因,当载体与片段连接成功,自杀基因无法正确表达,包含重组子的细胞可以正常生长;当载体与片段连接不成功,载体自连后自杀基因正确表达,包含自连空载体的细胞无法存活,即“零ZERO”背景。这种阳性筛选策略无需蓝白斑筛选,极大地加速了克隆筛选进程。
pZERO-Blunt Simple消除了插入位点附近的多克隆酶切位点,需要在PCR扩增引物上导入合适的酶切位点。此时如果使用PCR扩增引物导入的酶切位点进行DNA酶切时,酶切反应将不会受到T载体上其它多克隆酶切位点上的限制酶影响,可以大大提高酶切效率,增加亚克隆成功率。
操作步骤:
1. {C}连接反应的准备:
平末端PCR产物或者酶切后平末端片段可以通过琼脂糖凝胶电泳分离回收(使用长波紫外光下切胶或者可见光透射切胶避免DNA损伤造成连接失败)。与载体的摩尔比是 3:1。本公司生产的DNA产物快速纯化回收试剂盒对70bp以上的DNA片段能很好地进行回收。
2. 快速连接反应:
1) {C}在一个标准的10 ml连接反应体系中,加入1 ml 40ng pZERO-Blunt Simple载体、X ml PCR产物(在通常状况下,没有必要对PCR产物进行精确定量,一般PCR产物与载体的摩尔比优化至1:1~10:1就可以得到良好结果,推荐3:1,见附录)、5ml 2 ´ Quick ligation Buffer和0.9ml 的T4 DNA Ligase,其余用灭菌水补足。
反应按以下体系进行:
|
5ml |
2 ´ Quick Ligation Buffer |
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1ml |
pZERO-Blunt Simple载体 |
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Xml |
纯化后的PCR产物/或者1ml 1000bp control |
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Yml |
灭菌水 |
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0.9ml (5 Weiss Units/ml) |
T4 DNA Ligase |
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Final Volume |
10ml |
一般最后加入T4 DNA Ligase。
2) {C}22℃连接5-10分钟(一般可在PCR仪器完成)。
通常推荐22℃连接5-10分钟 ,>3kb长片段连接可以延长至30分钟。不推荐超过30分钟,超过可能降低转化子数量。
3) {C}冰上冷却,然后转化或贮存于-20℃。
3. 转化:
1) {C}100ml感受态细胞,置于冰上,完全解冻后轻掸几次将细胞均匀悬浮。
2) {C}加入4-5ml连接液(最多可全部加入,只要连接液体积不超过感受态细胞体积的1/10),轻轻混匀。冰上放置30分钟。
3) {C}42℃水浴热激90秒。冰上放置2~3分钟。
4) {C}加500ml LB或者SOC培养基(不含抗生素),37℃ 150 rpm振荡培养60分钟。
5) {C}将200ml细菌涂布在氨苄青霉素(100mg/ml)平板上。
涂布细菌的用量依连接的效率及感受态细胞的感受率而进行适当的调整,如果 预计的克隆较少,可通过离心(4,000rpm,2 分钟)后吸除部分培养液,留下适量的培养基悬浮菌体后取全部或者适量涂布于一个平板中(涂布剩余的菌液可以搁在4度保存,第2天如果转化菌落数量少,可将剩余菌液全部涂一个新培养板)。
6) {C}平板在37℃下正向放置1小时以吸收过多的液体,然后倒置培养过夜。
4. 筛选:
5. 常规检测:将得到的菌落接种 1-5 ml LB(含有终浓度为 100mg /ml 的氨苄青霉素)培养基,37℃摇床振荡培养过夜,保存菌种后提取质粒,应用 PCR 或酶切方法鉴定插入片段是否正确。
6. 快速检测:挑取菌落直接进行PCR检测(可参见分子克隆第3版本或者参考本公司CV05-通用T载体菌落PCR鉴定试剂盒说明书)。
7. {C}测序鉴定:使用试剂盒自带引物或者T7启动子引物测序确定是否含有目的克隆。
本试剂盒自带测序引物(也用于菌落PCR鉴定引物):
|
Forward sequencing primer, 23-mer |
5’-CGACTCACTATAGGGAGAGCGTC- 3’ |
|
Reverse sequencing primer, 24-mer |
5’-AAGAACATCGCTTTTCGATGGCAG- 3’ |
附录:
ð 如何计算连接反应中需要的PCR产物的量?
一般PCR产物与载体的摩尔比优化至1:1~10:1(推荐3:1)就可以得到良好结果,可采用以下公式:
[加入载体的量(ng)×插入片段大小(kb)÷载体大小(kb)]×插入片段和载体的摩尔比=插入片段的量(ng) 例如:插入片段和载体连接的摩尔比例为3:1,如连接反应中加入载体40ng,插入片段大小为500bp,这时应加入插入片段的量为[40ng载体×0.5kb插入片段÷2.974kb载体]×3/1=20.2ng。
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文献和实验后都只是平端产物。这种平端克隆往往效率低,并且有非特异性背景菌落产生,造成筛选困难。Topo平端克隆主要改良载体设计,把ccdB (Control of cell death)基因并入到mcs中,如果没有DNA片断插入,ccdB基因则会表达,ccdB基因的表达蛋白,会破坏细菌的DNA gyrase,造成细菌染色体的降解导致细菌死亡。如果有插入片断,则ccdB基因表达受到阻碍,所以细胞可生长。这样可以把高背景的缺点改善,节省筛选的时间。Topo平端克隆与Topo TA方法一样,操作简单快速。Zero
,ccdB基因的表达蛋白,会破坏细菌的DNA gyrase,造成细菌染色体的降解导致细菌死亡。如果有插入片断,则ccdB基因表达受到阻碍,所以细胞可生长。这样可以把高背景的缺点改善,节省筛选的时间。Topo平端克隆 与Topo TA方法一样,操作简单快速。 平端PCR 克隆 方法(Zero Blunt PCR Cloning Kit) Zero Blunt PCR 克隆 乃利用传统T4连接酶方法,但载体
℃,而拓扑异构酶I则偏爱室温。这个室温是指22-23℃,应特别注意。很多时候我们实验室的室内温度并不满足条件。TOPO克隆得到的菌落可能不如TA克隆多,不过质量高,95%左右都是重组子。价格约为5748元/20次,时间就是金钱,这下体会到了吧。 如果你用的是高保真酶,你可以选择在PCR之后加A,或者你直接选择平端克隆试剂盒。由于载体会自连,所以平末端克隆的背景会很高。为了避免这个问题,Invitrogen开发了Zero Background(零背景)技术,用在TOPO载体上。这个技术
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