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Pymol 制作优质的蛋白配体结合图像 - 空间互补

，300 处的 BTN 字母代表蛋白配体，红色的 0 代表水分子。3. 操作配体首先选中配体，两种方式（1）：在蛋白序列中点击 300 下的 BTN。（2）在图像中直接点击配体。此两种方式无优劣之分。选中配体后，配体上会出现红黑的小点，此时点击（sele）右边的 A 字符，选择 extract object 将配体输出到一个新的 object 中。4. 选中 obj01，点击其右侧的 S 字符，选中 Spheres。5. 选中 1stp，点击其右侧的 A 字符，下拉菜单中选中 remove water

有一种胖，反而有利于心血管健康！「肥胖悖论」新证据，源于脂肪

」，即与瘦人相比，肥胖者的短期和中期心血管疾病预后更好，但长期结果更差。通过更好地了解脂肪发出的「求救信号」，我们或许能够利用这一机制来改善肥胖和非肥胖人群的心脏健康状况。图片来源： Cell metabolism研究内容线粒体应激刺激脂肪细胞 sEV 释放为了建立脂肪细胞与心肌细胞 ROS 介导的通讯机制，研究者构建了 FtMT 过表达的诱导型、组织特异性小鼠模型（本文称为 adipo-FtMT 小鼠）。 与对照细胞相比，adipo-FtMT 脂肪细胞表现出更高的氧化应激水平。实验结果表明，dox

Pymol 展示氢键

序列，向右侧拉，红色「0」代表的是水分子。水的前面，蛋白序列的最后会出现蛋白配体。4. 选中 BTN，点击 sele 右侧的 A，下拉菜单中点击 zoom5. 按住鼠标左键进行拖动，旋转到合适的角度。6. 点击 wizard，下拉菜单中选择 measurement左键选择黄线两端的原子，进行测量，3.0A，氢键距离一般为 3.5A 以内，复合要求，点击 Done。7. 不断点击红框处，直到出现 ATOM。选择测量好的黄线两端的原子。点击 sele 右端的 label，选择 atom name。此时出现