KAPA HyperExplore 非人类序列捕获探针3Mb

三种基因表达数据的获得方法

的多，这些数据仅仅在有具体的关于实验条件的描述时才是有意义的，对于不同的细胞类型，在不同的条件下都有一套转录本。因此，基于 DNA 微阵列的基因表达数据存储量是非常大的，对于具有 20000 个探针的微阵列实验，以 10um 的分辨率扫描，产生 3 千万个离散的数据点，如果以 tiff 文件贮存，将占用约 60Mb 的硬盘空间。 一方面由于基因表达数据量非常庞大，而且数据中蕴含着丰富的生物学知识，另一方面由于这些数据没有注释，迫切需要一种标准来描述和存贮 DNA 微阵列基因表达数据，同时建立公共

基因表达的有力工具和统计方法全剖析

库里，包括完整和部分测序的基因组序列;更高级的功能信息存储在PATHWAY数据库里，包括图解的细胞生化过程如代谢、膜转运、信号传递、细胞周期，还包括同系保守的子通路等信息;KEGG的另一个数据库是LIGAND，包含关于化学物质、酶分子、酶反应等信息。KEGG提供了Java的图形工具来访问基因组图谱，比较基因组图谱和操作表达图谱，以及其它序列比较、图形比较和通路计算的工具，可以免费获取。 2. DIP 相互作用的蛋白质数据库(DIP)收集了由实验验证的蛋白质-蛋白质相互作用。数据

基因表达数据的获取

常大的，对于具有 20000 个探针的微阵列实验，以 10um 的分辨率扫描，产生 3 千万个离散的数据点，如果以 tiff 文件贮存，将占用约 60Mb 的硬盘空间。 一方面由于基因表达数据量非常庞大，而且数据中蕴含着丰富的生物学知识，另一方面由于这些数据没有注释，迫切需要一种标准来描述和存贮 DNA 微阵列基因表达数据，同时建立公共的 DNA 微阵列数据仓库。欧洲生物信息学研究所（ EBI ）与德国肿瘤研究中心 (DKFZ) 在 1999 年成立了 MGED 讨论