石蜡包埋组织基因组DNA抽提试剂盒(离心柱式)

石蜡包埋组织基因组DNA抽提试剂盒(离心柱式)

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  • 2025年12月08日
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    碧云天研发生产的石蜡包埋组织基因组DNA抽提试剂盒(离心柱式) (Paraffin-embedded Tissue Genomic DNA Purification Spin Kit),也称石蜡包埋组织基因组DNA提取试剂盒、包埋组织DNA抽提试剂盒、FFPE组织基因组DNA抽提试剂盒等,是一种采用环保脱蜡方式去除石蜡后抽提DNA的试剂盒。抽提获得的DNA可以应用于PCR、qPCR或基因组学研究等下游实验。

    福尔马林固定石蜡包埋(Formalin fixation and paraffin embedding, FFPE),常应用于癌症等疾病研究中保存离体组织的形态学和组织学结构,以便于运输和储存,是病理样品长期保存的主要方法之一[1]。组织样品经福尔马林固定时,组织内细胞中的核酸和蛋白质等分子间随机交联,核酸出现片段化,因此难以获得高质量核酸。本试剂盒采用环保脱蜡法去除石蜡,以特殊的裂解条件释放FFPE组织样本中的DNA分子,最大 程度地降低了福尔马林固定时组织内细胞中DNA与其它分子交联的不利影响,经本试剂盒抽提获得的DNA纯度高、完整性好、质量稳定。

    本试剂盒抽提DNA的实验流程如图1所示。首先使用环保的脱蜡剂和蛋白酶K将FFPE样品脱蜡、消化,随后加入适合DNA结合到纯化柱上的缓冲液,然后加入到纯化柱内。通过高速离心,使DNA在穿过纯化柱的瞬间,结合到纯化柱上,随后通过三次洗涤去除各种杂质,最后通过洗脱液把DNA洗脱下来。

    石蜡包埋组织基因组DNA抽提试剂盒(离心柱式)

    图1.碧云天石蜡包埋组织基因组DNA抽提试剂盒(离心柱式) (D0064)的实验流程图。

    本试剂盒抽提获得的石蜡包埋组织样品基因组DNA纯度高。本试剂盒提供的纯化柱对于DNA的最大容量约为30μg,抽提获得的DNA A260/A280的范围通常在1.6-1.9之间。本试剂盒与常见的T品牌同类产品的抽提效果对比图参见图2。

    石蜡包埋组织基因组DNA抽提试剂盒(离心柱式)

    图2.碧云天石蜡包埋组织基因组DNA抽提试剂盒(离心柱式) (D0064)与T品牌同类产品(Competitor T)的DNA抽提效果对比图。样品为小鼠肾脏和肝脏组织石蜡切片,样品用量为5片10μm厚切片。抽提后洗脱体积均为50μl,取10μl的洗脱样品与2μl BeyoRed DNA上样缓冲液(6X) (D0072)混合均匀后,在1%琼脂糖凝胶中电泳30分钟后拍照。如图所示,本试剂盒用于抽提小鼠肾脏、肝脏FFPE样品的DNA时,抽提得到的DNA的量与T品牌的同款试剂盒基本一致或略好。注:抽提得到的基因组DNA经RNase A处理。实际结果会因样品、实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。

    本试剂盒使用安全、高效。本试剂盒通过特殊的柱纯化介质进行DNA分离纯化,能有效避免常规方法抽提DNA时使用的酚、氯仿等有毒有害有机试剂。

    本试剂盒操作快速、便捷。本试剂盒采用柱纯化,无需繁琐的DNA沉淀步骤,纯化DNA操作过程仅需约15分钟即可完成。和国外同类柱纯化产品相比,所需操作步骤和操作时间基本一致。碧云天同时提供更加便捷的BeyoMag™石蜡包埋组织基因组DNA抽提试剂盒(磁珠法) (D0089)。

    本试剂盒的标准操作步骤抽提得到的总DNA含有少量RNA,但如果按照可选步骤加入RNase A,就可以获得不含RNA的高纯度总DNA。

    本试剂盒小包装可用于50个样品的总DNA抽提。

    包装清单:

    产品编号产品名称包装
    D0064S-1脱蜡剂50ml
    D0064S-2样品裂解液A10ml
    D0064S-3样品裂解液B11ml
    D0064S-4洗涤液I (首次使用前加17ml无水乙醇)13ml (+17ml)
    D0064S-5洗涤液II (首次使用前加39ml无水乙醇)26ml (+39ml)
    D0064S-6洗脱液11ml
    D0064S-7蛋白酶K1.1ml
    D0064S-8DNA纯化柱及废液收集管50套
    说明书1份

    保存条件:

    蛋白酶K -20ºC保存,其余均室温保存,一年有效。蛋白酶K室温(15-25ºC)存放一周,活力无明显下降。

    注意事项:

    如果希望获得更高质量的DNA,宜尽量使用新鲜固定和包埋的组织样品。拿到组织样品后尽快在4-10%福尔马林中固定,固定时间最好在8-24小时之间或更短时间,长时间固定会使DNA断裂更为严重。

    样品包埋前应确保彻底脱水,残留的甲醛可能抑制蛋白酶K的消化等相关实验步骤。

    本试剂盒抽提DNA依赖于样品类型、储存时间以及固定条件。样品固定时间和保存时间过长(>1年)易破坏DNA完整性,无法抽提出长片段。

    如需制备不含RNA的高纯度总DNA,需自备RNase A,推荐使用碧云天的RNase A (100mg/ml, DNase free) (ST577)。

    温度较低时样品裂解液A或样品裂解液B中可能会有沉淀产生,属正常现象。使用前必须检查一遍,如有沉淀,55ºC水浴孵育使沉淀溶解,混匀后使用。

    第一次使用前小包装洗涤液I需添加17ml无水乙醇,洗涤液II需添加39ml无水乙醇,混匀,并在瓶上做好标记。

    本试剂盒须将FFPE样品56ºC和90ºC孵育,推荐使用碧云天的BeyoBath™干式恒温金属浴(1.5/2ml×40) (E6662)。

    使用本试剂盒须提前备好无水乙醇。

    除特别说明外,每次Vortex应控制在5-10秒左右,推荐使用碧云天的BeyoVortex™调速式涡旋混匀仪(E6699)或BeyoVortex™基础型涡旋混匀仪(E6788)。

    本试剂盒所有操作均在室温进行,操作时无需冰浴。所有离心也均在室温进行。

    废液收集管在一次抽提中需多次使用,切勿中途丢弃。

    本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

    为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

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