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氨基酸及其衍生物靶向代谢组学
服务介绍:
靶向代谢组学是按照代谢组学原理和思路,对有限的几个或几类生物学相关的代谢物进行分析和研究的方法,通常是非靶向代谢组学发现差异代谢物后,再利用靶向代谢组学进一步系统的确证。
靶向代谢组学常用于氨基酸组学,植物激素,天然氨基酸等代谢物研究中,相较于非靶向代谢组学更具有针对性,并可对目标物进行绝对定量。
氨基酸衍生物是由氨基酸通过一系列反应化合而成的物质,例如氨基酸的联合脱氨基作用合成氨基酸衍生物,也就是说氨基酸衍生物的前身是氨基酸。人体内多种物质,如肾上-腺素、甲状腺激素就是氨基酸衍生物。除了构成动物机体及其产品蛋白质的20种氨基酸外,自然界中至今已发现存在将近200种其衍生物,在许多代谢通路作为底物和调控因子起着重要的作用,研究氨基酸及其衍生物的代谢变化为代谢类疾病(糖尿病、肥胖症、心血管疾病)的早期诊断及预测疾病发展提供研究基础。
主要设备:色谱仪Thermo UltiMate 3000 RS,质谱仪Thermo Q Exactive
主要设备:色谱仪Thermo UltiMate 3000 RS,质谱仪Thermo TSQ Quantun
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名称 |
规格 |
价格(元) |
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氨基酸及其衍生物靶向代谢组学 |
元/个 |
1200 |
实验流程:
标准品配制-方法开发-样本预试-样本处理-样本上机-数据处理
送样运输要求:
1、细胞样本
①细胞量1x107个,收集细胞沉淀,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液清洗三次,去除培养基成分,然后离心去除上清保存。
③如需要进行细胞计数,则需送样前进行。
2、全血样本
①样本量200uL,EDTA、EDTA-K2或肝素钠抗凝,4℃保存,冰袋运输,避免剧烈振荡和冷冻结冰。
②由于全血常规保存期为7天,如需检测,需要提前至少1周联系实验室确认周期情况,以便沟通协调安排检测。
3、血清样本
①样本量100uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样本应尽量避免溶血。
4、血浆样本
①样本量100uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样本应尽量避免溶血。
5、尿液样本
①样本量200uL,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②样本应尽量避免带入粪便残渣。
6、动物组织样本
①样本量300mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面血液,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
③固定液浸泡过的样本无法进行检测。
7、植物组织样本
①样本量500mg,-80℃保存,纯干冰运输,避免反复冻融。
②收集时,用预冷PBS缓冲液冲洗表面泥沙,并用滤纸吸干多余水分,避免冻存时结冰。
③固定液浸泡过的样本无法进行检测。
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文献和实验氨基酸及其衍生物靶向代谢组学
Theranostics | 空间代谢组学方法评估抗癌药物肿瘤靶向效率和瘤内分布异质性
癌症治疗研究中的关键问题是可区分正常组织和肿瘤组织的靶向抗肿瘤药物开发在新药研发的早期,如何快速评估抗癌药物的肿瘤靶向性非常重要,且了解药物在肿瘤内的异质性分布更具挑战。开发一种高精度、高灵敏度的定量成像分析方法有望解决这一难题。开发一种高精度、高灵敏度的定量成像分析方法有望解决这一难题。质谱成像是一种无需标记的分子成像技术,它可提供有关生物体内药物和代谢物分布的时空信息,其在药物开发领域的应用正在迅速增加。 中国医学科学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室贺玖明团队
。 与核磁共振等技术相比,色谱/质谱联用技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。具体应用而言,对于非靶向分析:色谱与高分辨质谱的联用必不可少;而对于靶向分析:基于多反应监测模式的三重四极杆质谱被认为是质谱定量的 “金标准”,也是靶向分析使用较多的方法;综合了两种技术优势的拟靶向代谢组技术是代谢组研究的新方向(图 3)。 图 3 | 拟靶向代谢组学的建立【2】(Zheng F.J. et al., Nature Protocols, 2020
中药药效及药理,药物活性分子研究评价:可通过代谢组联合其他技术手段系统地印证中药治疗的合理有效,也可通过动物实验找到一些具有治疗意义的药物活性分子。 4.代谢组学技术策略及优势 代谢组学技术的最常见分支就是非靶向和靶向分析的分支,非靶向方法尽可能多地监测到所有物质。靶向分析则聚焦于已知的组分数量上的变化,例如在胁迫和疾病的反应过程中,一些生物标志物的含量变化。近些年来,拟靶向代谢组技术发展迅猛,结合非靶向的高通量以及靶向分析的经典定量技术,拟靶向技术也逐渐成为代谢组学分析中不可或缺的组成
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