胆囊癌及匹配的癌旁组织芯片

GUT：国家癌症中心崔巍联合多组学技术团队发表血清代谢组肠癌早筛新机制

：四个研究队列（发现队列、建模队列、验证队列、血清和粪便匹配队列），每个队列中均有不同数量的正常人群（蓝色）、腺瘤（红色）和 CRC 患者（绿色）样本。 2、非靶代谢组分析：血清和粪便样本中提取的代谢物，进行 LC-MS 非靶代谢分析 3、靶向代谢物分析:血清中游离胆汁酸和脱氧胆汁酸 4、宏基因组测序和分类：提取粪便样本 DNA，使用鸟枪法进行宏基因组测序，并进行肠道微生物组的分类和功能分析。 5、空间代谢组分析：9 对人类结直肠组织样本（包括晚期腺瘤或 CRC 以及癌旁组织）进行 AFADESI

国自然“未来生物技术”项目指南——空间多维度组学

，发现并可视化表征了食管癌异常的代谢通路及其代谢酶。   研究思路 以人鳞片状食管癌（ESCC）组织为标本，包括癌组织、癌旁组织和远端非癌组织，制成冰冻组织切片。如图 1 所示，采用空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像技术（AFADESI-MSI），采集上述组织中内源性代谢物及其空间分布信息；对相邻切片进行 HE 染色；采用质谱成像数据处理软件，使质谱成像图与 HE 染色图匹配重合，按不同组织类型及空间分布提取代谢物轮廓信息；使用多变量统计分析，筛选出与肿瘤代谢相关的差异代谢物；根据差异代谢

空间代谢组经典问题答疑

3.能否介绍一下空间代谢组所用的自建数据库？ 空间代谢组与常规代谢组对于代谢物的定性需要通过与数据库匹配来获得定性信息。鹿明生物拥有 2 个空间代谢组自建库，包含胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多个种类代谢物； 另一个专门针对植物的空间代谢自建库，目前拥有涵盖生物碱类、酚酸类、黄酮类、香豆素类、苯丙素类、木脂素、萜类等 10 大类代谢物。 数据库的建设经过文献、公共数据库、标准品、人工校对等去增加定性的可靠性。   4.空间代谢