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文献和实验GUT:国家癌症中心崔巍联合多组学技术团队发表血清代谢组肠癌早筛新机制
:四个研究队列(发现队列、建模队列、验证队列、血清和粪便匹配队列),每个队列中均有不同数量的正常人群(蓝色)、腺瘤(红色)和 CRC 患者(绿色)样本。 2、非靶代谢组分析:血清和粪便样本中提取的代谢物,进行 LC-MS 非靶代谢分析 3、靶向代谢物分析:血清中游离胆汁酸和脱氧胆汁酸 4、宏基因组测序和分类:提取粪便样本 DNA,使用鸟枪法进行宏基因组测序,并进行肠道微生物组的分类和功能分析。 5、空间代谢组分析:9 对人类结直肠组织样本(包括晚期腺瘤或 CRC 以及癌旁组织)进行 AFADESI
杂交测序(sequencing by hybridization,SBH)
上特定位点的碱基特征。所以在实际操作中,杂交必须保证能够区分完全匹配和不完全匹配的探针。如果芯片 上包含72个碱基长度的寡核苷酸探针的所有可能组合和未知的检测DNA序列杂交,理论上,检测核酸任意,1个连续碱基区段都能找到互补的固定探针并与之杂交,称之为完全匹配杂交。其杂交信号比含错配DNA的杂交信号强,根据完全匹配杂交探针的重叠序列排列,重组探针,再现检测核酸的序列,这种方法就是杂交测序。 SBH所选择探针的碱基个数受杂交技术的发展限制,也和所检测的核酸复杂度有关。选择的长度至少必须有一定
是芯片实验室仪器的主要组成部分,其体积的大小直接决定了芯片分析仪的大小,因此人们正努力追求将这两部分做到最小。 电化学检测由于其体积较小,与高压电源一起可制成便携式分析仪在尺寸上和芯片实验室的概念匹配,加之有电化学响应的物质很多,所以在芯片中的应用研究较多。电化学检测器的一般做法是将电极集成到芯片上,采用安培或电导法进行检测,其中电泳分离电压对检测电流的干扰是电化学检测需要克服的问题之一。用于电化学检测的电极材料有碳糊、碳纤维、铜丝、金丝等。被检测物质有氨基酸、肽、碳水化合物、神经递质等。把电泳
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