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文献和实验GUT:国家癌症中心崔巍联合多组学技术团队发表血清代谢组肠癌早筛新机制
:四个研究队列(发现队列、建模队列、验证队列、血清和粪便匹配队列),每个队列中均有不同数量的正常人群(蓝色)、腺瘤(红色)和 CRC 患者(绿色)样本。 2、非靶代谢组分析:血清和粪便样本中提取的代谢物,进行 LC-MS 非靶代谢分析 3、靶向代谢物分析:血清中游离胆汁酸和脱氧胆汁酸 4、宏基因组测序和分类:提取粪便样本 DNA,使用鸟枪法进行宏基因组测序,并进行肠道微生物组的分类和功能分析。 5、空间代谢组分析:9 对人类结直肠组织样本(包括晚期腺瘤或 CRC 以及癌旁组织)进行 AFADESI
引进 Waters SYNAPT XS 质谱成像系统,不断研发更高的空间分辨率。我们要根据自己关注的组织微区大小去选择合适的分辨率。 比如对于脑组织、肾脏组织、心脏组织等样本经过切片后尺寸在 1cm*1cm 左右,利用 100um*100um 分辨率就可以满足对关注的微区结构进行图像分析,此时我们不一定需要选择更高的分辨率进行检测。 对于一些小体积样本,比如样本尺寸在 5mm*5mm 以下,为了获得足够的像素点,形成更加清晰的成像图,并且关注的组织微区需要更高的分辨率才能获得足够的信息。
。这些现象表明,大家可以寻找肝癌患者血清血浆中高含量的microRNA,以此作为生物标志物进行肝癌的早期诊断。在本文中,科学家们利用AgilentmicroRNA芯片筛选、RT-PCR验证等方法寻找到7个microRNA的组合,这一组合能对乙型肝癌(hepatitis Bvirus related HCC)患者进行早期诊断。相关成果发表在2011年11月的《Journal of Clinical Oncology》上。microRNA生物芯片技术服务由上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究
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