脑肿瘤及匹配癌旁或边缘组织组合芯片

GUT：国家癌症中心崔巍联合多组学技术团队发表血清代谢组肠癌早筛新机制

：四个研究队列（发现队列、建模队列、验证队列、血清和粪便匹配队列），每个队列中均有不同数量的正常人群（蓝色）、腺瘤（红色）和 CRC 患者（绿色）样本。 2、非靶代谢组分析：血清和粪便样本中提取的代谢物，进行 LC-MS 非靶代谢分析 3、靶向代谢物分析:血清中游离胆汁酸和脱氧胆汁酸 4、宏基因组测序和分类：提取粪便样本 DNA，使用鸟枪法进行宏基因组测序，并进行肠道微生物组的分类和功能分析。 5、空间代谢组分析：9 对人类结直肠组织样本（包括晚期腺瘤或 CRC 以及癌旁组织）进行 AFADESI

转录组的研究

在原发脑肿瘤的发病机制与恶性转变过程中有重要作用。Andoerson等用芯片技术研究胰腺癌细胞株PANC―1在具有抗增殖作用的5―B旨氧化酶抑制因子MK886诱导下基因表达谱的变化，结果显示在癌基因f―myc表达下降的同时，细胞周期蛋白D1、D1等其他癌基因的表达有上调趋势，表明肿瘤化疗在抑制某些癌基因的同时，会代偿性诱发其他癌基因的过度表达，提示是化疗无效和肿瘤耐药或抗药的机制之一。Kononen等利用基因芯片技术研究了正常前列腺组织、早期局限性前列腺癌组织和复发激素非依赖性前列腺癌组织中的基因

三种基因表达数据的获得方法

expression ， SAGE )、 RT-PCR 等。目前，高通量检测基因组 mRNA 丰度的方法主要是 cDNA 微阵列、寡核苷酸芯片，它们的原理是相同的，即利用 4 种核苷酸之间两两配对互补的特性，使两条在序列上互补的单核苷酸链形成双链，这个过程被称为杂交。基本技术路线是：制备芯片，在一个约 1cm 2 大小的玻璃片上，将称为探针的 cDNA 或寡核苷酸片段固定在上面;从细胞或组织中提取 mRNA ，通过 RT-PCR 合成荧光标记的 cDNA ，与芯片杂交;用激光显微镜或荧光显微镜检测杂交后的芯片