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北京百泰派克生物科技有限公司
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蛋白质肽段覆盖率
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蛋白质是由氨基酸脱水缩合形成的长链生物大分子,在蛋白质质谱鉴定中通常利用质谱仪检测蛋白质酶解产生的小分子肽段来实现完整蛋白质的分析,蛋白质肽段覆盖率是指这些小分子肽段所包含的氨基酸数量占整个蛋白质总氨基酸的比率。肽段覆盖率对蛋白鉴定的可信度判定具有重要意义,肽段覆盖率越高,所鉴定的蛋白可信度就越高;反之,说明所鉴定的蛋白质可信度较低。在蛋白质鉴定特别是序列鉴定中,通常采用多重酶解的方式利用不同的蛋白质酶分别对靶蛋白进行酶切来提高肽段覆盖率,在得到更多的碎裂肽段片段的同时实现对靶蛋白序列的100%覆盖。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台结合Nano-LC色谱,提供快速高效的蛋白质肽段覆盖率分析服务技术包裹,可用于判定蛋白质一级结构的可信度,完善蛋白质的理化信息,欢迎免费咨询。
其他服务项目

优质检测平台
(1)基于生物化学、分子生物学、色谱的检测分析平台
该平台配备了Agilent 2100 生物分析仪、ProteinSimple凝胶成像系统、高效液相色谱系统,为蛋白质组学、代谢组学分析保驾护航,包括样品制备、分离纯化分子量测量、杂质表征表达研究等:
(2)基于质谱技术的蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白测序平台
该平台配备了超高效液相色谱质谱联用,Orbitrap Fusion Lumos Tribri,Thermo Scientific Exploris以及氢气交换质谱仪配合机械臂为蛋白贡组学、代谢组学和蛋白测序提供了全面的分析手段,包括蛋白质和代谢物的分离、质谱分析、结构分析以及动态信息研究;
(3)生物药物表征平台
该平台配备了DSC-FTRR差示扫描量热仪与傅立叶变换拉曼光谱仪,氢气交换质谱仪配备机械臂,为生物药物表征提供了全面的分析手段,包括生物药物的分离、纯化、结构分析和动态信息研究:
(4)基于10x Genomics的单细胞分析平台
该平台能够完成基于10x Genomics单细胞分析平台的检测流程包括单细胞分选、cDNA合成、文库制备、文库质量检测、PCR扩增以及高通量测序;
(5)基于Fluidigm的单细胞质谱流式检测平台
采用基于Fluidigm Helios流式细胞仪(Mass Cytometry Systemfor Single Cell Analysis)用于单细胞质谱分析,该平台能够完成包括单细胞捕获、cDNA合成、实时定量PCR分析、目标区域扩增以及质谱流式细胞分析;
(6)基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台
基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台,能够完成包括多肽分离、纯化、合成、质谱分析、免疫学检测以及分子相互作用研究;
(7)生信云平台
基于生物信息分析方法的生信云平台,能够完成一整套的生物信息学解决方案,包括组学数据的质量分析、差异表达分析、差异表达物GO、KEGG、COG注释分析、聚类分析、相互作用网络等多层次网络和通路的分析。
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。
1.公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;
2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;
3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;
4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;
5.服务3000+企业,10000+客户的选择;
6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!
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文献和实验,现在一般都采用多酶切进行。 • 蛋白质肽段的检出受蛋白含量、抽提溶解效率、其它杂质、离子化模式以及质谱检测性能等诸多因素的影响。外来蛋白的污染会带来结果的假阳性、抽提中残留的盐和变性剂的会影响离子化效率。 • 基于肽段分析的蛋白质组鉴定方法分为三类:⑴基于理论酶解蛋白肽库的肽质量指纹图谱法,此法随着搜索数据库容量的急剧增加要求质谱提供更为精确的肽段质量数值,以及检出更多的肽段以提高匹配覆盖率;⑵来自于串联质谱具有合适匹配质量数的单肽段的碰撞诱导解离(CID)谱;⑶de novo策略
-MS/MS系统使一次实验鉴定上万个蛋白成为可能。基于LC-MS/MS系统方案也叫shot-gun法,质谱的采集模式为DDA(Data Dependent Acquisition)。在这种模式下,质谱根据离子化的肽段母离子的强度,依次选择10到20个强度最大的离子进入串联质谱,进行进一步碎裂,然后经过与模板蛋白质数据库比较确认。这种方法无疑丢失了大量有用的肽段母离子信息。此外,经过二级碎裂的二级谱图,在后期使用软件鉴定中也仅有少量谱图得到解析(约30%),大部分谱图依然得不到有效利用。由于质谱选择离子的随机
效率高、时间短,不会增加工作量。只要掌握了一般的蛋白质组学分析技术,就能完成iTRAQ定量实验。 主要特点: 1、一次实验同时定量4或8个样品,极大提高了通量。 2、技术路线简单,不需要额外的烦琐操作。 3、能够增强二级碎片离子信号,能产生更好的y离子和b离子系列,二级谱图质量更好。 4、标记所有的肽段,提高了蛋白质组的覆盖率,包括翻译后修饰,而且提高了鉴定和定量的可信度。 由于iTRAQ定量实验具有操作简单、重复性好、定量效果好等特点,所以得到
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