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北京百奥智汇科技有限公司
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单细胞转录组与单细胞ATAC同时检测
真核生物的核DNA复制转录是需要将染色质打开,从而允许一些调控因子结合,这种特性称为染色质的可及性。染色质的可及性被认为与转录调控密切相关。
10x Genomics单细胞ATAC-seq可以在单细胞水平对细胞染色质开放区域进行检测,获得单个细胞的转录因子的调控差异,为细胞异质性提供表观层面的解释,为了解生命活动中染色质的动态变化,下游基因的转录调节等方面提供强有力的技术支撑。
在上述技术基础上,10x Genomics的技术还可实现同一个细胞核基因表达(RNA)和染色质开放区域(ATAC)的同时检测。表观遗传学和基因表达谱相结合,让发现能力倍增。通过关联的转录和表观遗传学分析加深对细胞类型和状态的描述,有助于深度了解肿瘤异质性的驱动因素、治疗耐药机制以及神经退化疾病或免疫疾病的细胞类型。
产品特色
- 高通量 单个样本可分析500-20,000个细胞的数据
- 高捕获率 平台捕获效率高达65%
- 低成本 相比其他捕获平台或传统酶切方法,成本大幅降低
- 新角度 ATAC检测发现新的基因调控相互作用
- 多组学、无偏差 同一个细胞中直接整合基因表达和染色质可及性
- 高性价比 从同一细胞中获得多重数据,最大限度地挖掘珍贵样本
兼容样本类型
- 新鲜组织、血液、细胞悬液、细胞系等均可进行实验
技术原理

首先将样本(组织或细胞)制备成单细胞核悬浮液,加入Tn5转座酶对染色质开放区域进行剪切以获得片段化DNA,同时在DNA片段末端添加测序引物;其次将带有条码的凝胶珠和单个细胞包裹在油滴中形成GEMs,凝胶珠在油滴内溶解后能够与细胞核裂解释放的DNA或DNA+RNA结合完成单细胞标记。标记完成后,即可构建单细胞ATAC文库或单细胞转录组文库+单细胞ATAC文库。
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