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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
充足
- 供应商:
南京诺唯赞生物科技股份有限公司
- 保存条件:
-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
- 规格:
6 rxns/12 rxns/24 rxns
| 规格: | 6 rxns | 产品价格: | ¥3500.0 |
|---|---|---|---|
| 规格: | 12 rxns | 产品价格: | ¥6000.0 |
| 规格: | 24 rxns | 产品价格: | ¥11700.0 |
Ribo-clean rRNA Depletion Kit Mega (Bacteria)
原核rRNA去除试剂大升级,更多物种,更少残留,一盒搞定。

原核生物rRNA去除

Ribo-clean rRNA Depletion Kit Mega (Bacteria)是针对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA中去除rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始模板量为0.01 - 1 μg的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA,总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNase I消化等步骤,最终将rRNA (包括5S、16S、23S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA及其他非编码RNA;本试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本,得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA (例如IncRNA)分析。优化的反应体系提高了去除效果和物种兼容性。

- 兼容包括细菌、蓝藻、古细菌、立克次氏体等的原核物种
- 可兼容复杂环境样本中的多种混合原核生物去除
- 时间流程仅1h

使用多种细菌样本作为模板,分别使用RN417及友商同类型产品进行rRNA去除后,使用Vazyme#NR606进行文库构建,通过分析rRNA ratio数据,比较友商产品与RN417去除效果,其中友商试剂针对革兰氏阴性菌及革兰氏阳性菌分别使用对应的试剂盒进行实验。结果显示使用RN417进行rRNA去除处理的革兰氏阴性菌及革兰氏阳性菌上样本,rRNA残留率均低于5%,且表现显著优于友商同类型试剂。


图1. RN417针对单物种样本的rRNA去除效率
对从污泥及污水样本中提取的RNA模板,使用Vazyme# RN417进行rRNA去除后,使用Vazyme# NR606进行文库构建,通过分析rRNA ratio数据,分析比较去除前后复杂样本中原核生物的rRNA 残留。结果显示,未去除组中共检出1800+种原核生物,在去除组中rRNA残留总和统计可降低至0.5%以内。

图2. RN417针对复杂样本的 rRNA去除效果



-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
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文献和实验与磁珠表面上修饰的Oligo(dT) 分子杂交。杂交后,除去无聚腺苷酸化的RNA。磁珠清洗,然后通过提高温度实现mRNA的洗脱(图 2)。 图1 | poly(A) RNA 分选示意图。该工作流程改编自Lexogen 的 Poly(A) Selection Kit。 在poly(A)分选的过程中,由于绝大多数的rRNA分子无poly(A)结构,因此可以除去这些 rRNA 分子。通常只会有约 2 – 5% 的reads数mapped到线粒体 rRNA,因为这些线粒体rRNA有 poly(A) 尾
through. 4) Repeat the wash step once. 5) Discard the tube and place the column into a clean Wash Tube, supplied with the kit. 6) Centrifuge the column at ≥12,000 × g for 2–3 minutes at room temperature to remove any residual Wash Buffer
,所以我必须除掉他们! 若是有足够多的total long RNA,可以分两步来做:一先先从total long RNA中提取Poly A+ RNA,二再用ribo Minus kit除去仍然残留的rRNA;若是没有足够多的total long RNA,就直接用ribo Minus kit除去rRNA。 Qiagen和Invitrogen都有kit来提取Poly A+ RNA,效果感觉差不多,不过好像有的人更喜欢Invitrogen的,Qiagen的要相对便宜点(单价贵,但是能够处理






