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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
-20°C储存
- 英文名:
FFPE DNA/RNA Kit
- 库存:
期货
- 供应商:
上海阿拉丁生化科技股份有限公司
- 规格:
F666120-50T
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产品简介:
本试剂盒适用于从石蜡包埋组织中有效纯化基因组DNA及总RNA。本品使用专门 优化脱蜡剂和裂解液,释放组织切片样本中的DNA、RNA,不涉及有机试剂二甲苯, 无需过夜操作;消化后的样品在较高的温度孵育后,去除由交联造成的抑制作用,有 效提高核酸的产量和纯度;优化的缓冲系统使裂解液中的核酸可特异结合到吸附膜 上,抑制剂通过两步漂洗步骤有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可获得高 纯度DNA、RNA。同时配置高效微量吸附柱,洗脱体积可低至20μl。经过纯化的 DNA、RNA可以直接用于PCR、Real-time PCR、SNP基因分型、STR基因分型、二 代测序、药物基因组学研究和印迹分析等实验。
自备试剂:
无水乙醇
实验前准备及重要注意事项
1.获得样品后,要尽快将样品固定,固定时间以14-24小时为宜,时间过长易导致 DNA、RNA断裂,影响下游实验。如果甲醛固定时间过长或样本存放时间过久 (>1年)则易导致DNA完整性受损,无法扩出长片段。
2.确保包埋前的样品彻底脱水,残留的福尔马林会抑制Proteinase K的作用。
3.向Proteinase K中加入1.25 ml Proteinase K Storage Buffer使其溶解,-20℃保存。 配制好的Proteinase K勿长时间室温放置,以免影响其活性。
4.第一次使用前应按试剂瓶标签说明先在Buffer RW2、Buffer GW1和Buffer GW2中 加入无水乙醇。
5.使用前请检查Buffer GTL、Buffer GL和Buffer DS是否出现结晶或者沉淀,如有结 晶或者沉淀,请将Buffer GTL、Buffer GL和Buffer DS于37℃水浴重新溶解。
6.实验开始前将水浴锅或恒温混匀仪预热至56℃。
7.请使用常温离心机,或将离心机温度设置为25℃,若温度低于15℃可能会导致吸 附柱堵塞。
8.预防RNase污染,应注意以下几方面:
1)使用无RNase的塑料制品和枪头,避免交叉污染。
2)玻璃器皿应在使用前于180℃高温下干烤4小时,塑料器皿可在0.5 M NaOH中 浸泡10分钟,用水彻底冲洗后高压灭菌。
3)配制溶液应使用无RNase的水。
4)操作人员戴一次性口罩和手套,实验过程中要勤换手套。
操作步骤
石蜡包埋样本
1.将组织块多余的石蜡修剪掉,露出组织后切成5-10 µm的薄片。
2.取约1×1 cm2 的切片(共约1-5片切片)置于离心管(自备)中,加入500 μl Buffer DS, 涡旋震荡10秒。短暂离心将样本收集到管底。56°C孵育3分钟,水浴锅中取出后静 置,降至室温后进行下一步操作。 注意:如果样品表面暴露在空气中,最初的2-3片弃掉不用。
3.12,000 rpm离心2分钟,小心彻底吸弃上清液,不要吸到沉淀。可用小枪头(10μl)小 心去除残留的脱蜡液。
4.上述管中加入180 μl Buffer GTL和20 μl Proteinase K,涡旋震荡混匀。
5.56℃孵育15分钟,然后冰上放置3分钟。室温,12,000 rpm离心15分钟。
6.转移上清液至新的1.5 ml离心管用于RNA提取,注意不要吸到未消化组织。将沉淀 用于DNA提取。
RNA提取
7.把第6步得到的上清液,80℃孵育15分钟。
8.加入320 μl Buffer GL,涡旋震荡混匀后加入720 μl无水乙醇,立即涡旋震荡混匀。
9.所得的溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns RS)中,一次不能 加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附 柱重新放回收集管中。 注意:若吸附柱堵塞,可能是样本量过多,应考虑将起始切片数量减少为1-2片。
可选步骤:
a. 向吸附柱中加入350 μl Buffer RW1,12,000 rpm离心1分钟,弃废液,将吸附柱重 新放回收集管中。
b. 配制DNase I 混合液:取52 μl RNase-Free Water,向其中加入8 μl 10×Reaction Buffer和20 μl DNase I(1 U/μl),混匀, 配制成终体积为80 μl的反应液。
c. 向吸附柱中直接加入80 µl DNase I 混合液,20-30℃孵育15分钟。
d. 向吸附柱中加入350 μl Buffer RW1,12,000 rpm离心1分钟,弃废液,将吸附柱重 新放回收集管中。 向吸附柱中加入500 μl Buffer RW2,12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液, 将吸附柱重新放回收集管中。若需去除基因组DNA,可按照以下步骤进行
11.重复步骤10。再12,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温5 分钟以彻底晾干。
12. 将吸附柱置于一个新的无RNase离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入20-50 μl RNase-Free Water,室温放置5分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集RNA溶液, -80℃保存。
DNA提取
7.取第6步获得的沉淀,加入180 μl Buffer GTL和20 μl Proteinase K至沉淀中。涡旋 15秒重悬沉淀。
8.56℃孵育1小时,直至样品完全溶解。90℃孵育1小时。
9.加入200 μl Buffer GL,涡旋震荡混匀后加入200 μl无水乙醇,涡旋震荡彻底混匀。 短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
1.将步骤9所得溶液全部加入已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DF)中,一次 不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将 吸附柱重新放回收集管中。 注意:若吸附柱堵塞,可能是样本量过多,应考虑将起始切片数量减少为1-2片。
11.向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1,12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废 液,将吸附柱重新放回收集管中。
12.向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2,12,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废 液,将吸附柱重新放回收集管中。 注意:如需进一步提高纯度,可重复步骤12。
13.12,000 rpm离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温5分钟以彻底晾干。 注意:这一步目的是将吸附柱中残余乙醇去除,乙醇残留会影响后续酶促反应。
14.将吸附柱置于一个新的1.5 ml离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入20-50 μl Buffer EB,室温放置5分钟,12,000 rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存。
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文献和实验材料与试剂 1. TUNEL试剂盒: ①从瓶2中取出标记液100μl分别作为两个阴性对照。 ②将瓶1的全部溶液50μl加入瓶2剩余的450μl标记液中,使其成为500μl的TUNEL混合物。 2. POD转换液(一旦溶解,储存于4℃,不得再冻存) 3. 漂洗液:PBS 4. 固定液:4%多聚甲醛(用pH7.4的PBS配)。 5. 封闭液:0.3%H2O2 (用甲醛配)。 6. DBA:金属增强底物剂。 7. 细胞透化液:0.1%Trition X
浓度不佳:适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。镁离子浓度过高:适当降低镁离子浓度,或选择更合适的mix试剂盒。模板有基因组的污染:RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。5. 溶解曲线不止一个主峰引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。引物浓度不佳:适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。镁离子浓度过高:适当降低镁离子浓度,或选择更合适的 mix 试剂盒。模板有基因组的污染:RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,或通过引物设计避免非特异
在细胞培养 过程中,经常少不了HEPES缓冲液。那么,HEPES缓冲液的配制和使用方法怎样呢?HEPES缓冲液是一种弱势,在开放式的培养条件中,若加入HEPES,可防止培养基内pH氧化升高,从而将PH维持在7.0左右。 HEPES分子 量为238.31,化学名:4-羟乙基哌嗪乙磺酸,分子式: C8H18N2O4S。 HEPES常用于生物缓冲剂,pH值缓冲范围:6.8-8.2,用在生化诊断试剂盒、DNA/RNA提取 试剂盒及PCR诊断试剂盒
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