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北京诺禾致源科技股份有限公司
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微生物多样性测序
诺禾致源微生物多样性测序
二代16S/18S/ITS 等扩增子测序
16S、18S、ITS等扩增子测序（二代） 一步到位检测环境微生物多样性
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域，
通过检测目标区域的序列变异和丰度，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。
1、应用方向
医学领域：疾病与人体微生物间关系，如代谢类疾病、消化类疾病、自身免疫性疾病、肿瘤癌症、神经类疾病及其他疾病等
环境领域：某一特定环境（雾霾、沙尘等污染环境，住宅、商场等生活环境）的微生物群落组成，有机肥发酵处理、污水治理、石油降解、水体及海洋等微生物群落分布和组成等
畜牧领域：肠道、瘤胃等微生物与动物繁殖、生长发育、营养健康、免疫和疾病治疗等的互作关系
农业领域：根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等
生物能源：特殊功能的菌株、工程菌的开发
特殊极端环境：极端环境条件下的微生物类群研究
2、诺禾优势
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读长长, 周期短, 性价比高
采用 NovaSeq 6000 测序平台。NovaSeq 6000 测序平台通量更高，速度更快，运行时间更短，周期最短可达10天 -
科学方案设计
从材料选取，建库测序，到数据分析， 每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果
3、信息分析
基于目标区域的测序，检测序列丰度，以充分研究环境微生物多样性和群落结构差异性。除QIIME1流程外，诺禾还实现全流程QIIME2分析，QIIME2中的插件DADA2可以修正测序错误，注释更为精准，且提供了多种可交互式图形系统展示。
| 标准分析 | 解决问题 |
| 物种注释 | 物种注释及各物种丰度信息 |
| α-多样性分析 | 微生物群落的丰富度和多样性 |
| β-多样性分析 | 不同样本间的微生物群落 及各样本差异情况 |
| 多元统计分析 | 寻找组间具有显著差异的物种， 同时可以比较组内差异和组间差异 的大小，判断分组是否有意义 |
| CCA分析 | 研究物种组成与环境因子间的关系 |
| 环境因子关联分析 | |
| VPA分析 | |
| 功能预测 | 预测样本的功能组成 |
| 高级分析 | 解决问题 |
| 肠型分析 | 肠道菌准确定位和疾病预测和治疗 |
| 贝叶斯网络图 | 判断微生物之间、微生物和环境、 代谢物间的依赖关系 |
| Source Tracker | 样本中微生物群落来源 |
4、送样建议
| 样本类型 | 建议送样量 | 最低送样量 |
| 土壤/污泥/沉积物/腐殖质 | 3g | 0.5g |
| 水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm) | 2张 | 1张 |
| 拭子 | 3个 | 1个 |
| 瘤胃液/发酵液/组织液(离心有明显沉淀) | 3mL，沉淀1g | 1mL，沉淀0.5g |
| 粪便/肠道内容物 | 2g(小鼠 6 粒) | 0.5g(小鼠 3 粒) |
| 动物/人组织 | 1g | 0.5g |
| 血浆 | 3mL | 1mL |
| 鲜奶 | 20mL | 8mL |
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文献和实验作用机理的理解，继人类基因组计划之后，科学家们又启动了人类元基因组计划，这使肠道菌群的研究迎来了一个新的浪潮。 在以往的肠道微生物群落多样性研究中，人们主要采用DGGE等分子生物学方法及生物芯片对肠道菌群进行研究，但是这些方法都存在一定的缺陷。如DGGE只能检测到环境样品中十几种优势菌，但是对痕量微生物却束手无策；电泳条带中包含不只一种16S rDNA序列，要获悉具体的菌种信息，还需进行克隆、测序，实验操作繁琐；此外，采用这种方法不能反映微生物的丰度情况。而生物芯片通过固定在芯片上的探针来获得微生物多样性
了土壤的质量。土壤微生物多样性一般包括微生物分类群的多样性、遗传(基因) 多样性、生态特征多样性和功能多样性[3 ]。由于土壤微生物的复杂性、土壤本身的多变性和研究方法不完善等原因的限制, 以往人们对土壤微生物多样性的研究与动、植物相比远远落后。随着多聚酶链反应(PCR)、核酸测序等现代生物学分子生物学技术的迅速发展, 人们对土壤微生物多样性有了更多的了解；高通量测序技术的发展则为研究土壤宏基因组提供了大量数据，为直接探究土壤中的微生物群落结构提供了客观而全面的信息。 一、对土壤微生物进行
喝啤酒竟然还有好处？最新研究表明：每天一瓶啤酒，可改善男性肠道健康
风险。 图片来源：Journal of Agricultural and Food Chemistry 在这项双盲研究中，22 名健康男性被随机分为两组，他们在 4 周的随访期内每天饮用 330 毫升无酒精啤酒或含酒精拉格啤酒（酒精浓度 5.2%）。在试验前后，分别采集血液和粪便样本，并采用 16S rRNA 基因测序分析肠道菌群。 研究结果表明，参与者的体重、体重指数（BMI）、心脏健康和新陈代谢的血清标志物在研究期间没有变化。但在 4 周结束时，两组的肠道微生物组多样性更高，粪便中碱性
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