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RNA 免疫共沉淀测序技术是将染色质免疫沉淀技术
RNA 免疫共沉淀测序技术是将染色质免疫沉淀技术(RNA Immunoprecipitation, RIP)与新一代测序技术(NGS)相结合,能够高效地在全转录组范围内检测与调控蛋白、转录因子等特定蛋白相互作用的RNA。利用该种技术,通过将测序结果精确定位到基因组上,研究人员可获得全转录组范围内与特异蛋白互作的RNA 序列或种类。
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文献和实验SLAM-seq—RNA合成及降解代谢动力学分析,基因动态表达研究的首选 基因表达是一个动态的过程,取决于细胞内环境的稳态以及对环境的适应性,基因信息调控的转变可能会导致人类疾病的发生。这些基本生物学进程的背后是一个非常精密的分子调控事件,它们控制着RNA转录,加工和降解相关的动力学(图1)。了解基因调控的分子基础需要以转录特异性和系统的方式深入了解RNA合成和降解相关动力学。但是,对于常规的RNAseq,我们只能获得终点水平的RNAs丰度信息,无法区分及定量新合成的新生RNAs水平
干货 | CUT and Tag 让 ChIP-Seq更简单高效!
CUT&Tag 技术原理及应用 CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是替换传统的 ChIP-Seq 用以研究蛋白质-基因组互作的新技术,与后者相比,它具有信噪比高、可重复性好、实验周期短(1 天实现从细胞到文库构建)、细胞投入量低等显著优势,尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。 图 1. CUT&Tag 实验原理 CUT
免疫组库是哪位? 能够称为“组库”,首先是功能相似的N多细胞的集合。而“免疫”是指免疫细胞,特指 T/B 淋巴细胞。“So~免疫组库”(Immune Repertoire,IR),指某个体,特定时间点下,所有功能多样性T/B淋巴细胞的总和。T/B细胞利用细胞表面受体(TCR/BCR)识别和结合抗原,介导机体产生针对性的免疫应答,发挥免疫功能并做好记录备案,如果该抗原再次入侵可迅速作出反应,作为健康卫士守护肌体城池。 “组库”从哪来? 除了 n 多 T/B 细胞的集合,TCR/BCR
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