T4 UvsX Recombinase

公司产品仅供科研研究使用、不得用于临床诊断！

描述:

UvsX 重组酶，来源于 T4 噬菌体，是 RecA/Rad51家族的同源体。RecA/Rad51 重组酶家族在双链 DNA 断裂的无误修复和复制叉重新启动的过程中起到重要作用。
T4 UvsX 重组酶可与其他重组酶一起锚定在单链 DNA 上并激活其在其他双链 DNA 上寻找同源序列，以进一步完成链置换。经检测，该酶无核酸酶活性。

货号	产品名称	规格
XG-P3112	T4 UvsX Recombinase	300μg
XG-P3112	T4 UvsX Recombinase	3mg

储存：

置于-20°C 可保存 1 年，-80°C 长期保存，短期使用置于 4°C，保存一个月，避免反复冻融。
热失活：60°C，10min。
酶储存液：50 mM Tris-HCl, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1 mM
EDTA, 10% Trehalose, pH 7.5。2xRPA BufferMix：包含反应缓冲盐、ATP、磷酸肌酸、dNTP、PEG、DTT、BSA 等，可用于 RPA 扩增试验。该试剂 4°C
条件下放置 1 个月性能无下降。
基于本蛋白进行 RPA 反应测试的全套试剂

用于 RPA 扩增的测试引物与探针
CPV-F（20uM） CACTTACTAAGAACAGGTGATGAATTTGCTACAG
CPV-R（20uM） AGTTTGTATTTCCCATTTGAGTTACACCACGTCT
Probe（10uM） CCTCAAGCTGAAGGAGGTACTAACTTTGGT[dT-BHQ1]
[THF][dT-FAM]ATAGGAGTTCAACAAG -(C3)
Canine parvovirus type 2,VP2
加入 1μl 的模板 DNA，上机反应前加入 1.25 μl 的 280 mMMg(OAC)2（终浓度 14 mM），总反应体积 25 μl。混合均匀，并离心，置于 39-42℃条件下反应 30min。
2. 进行荧光 RPA 扩增在进行荧光检测时体系中，额外加入 0.3 μl 的 10μM Probe（120 nM的终浓度）和 50U 的 Exonuclease III（2U/μl 的终浓度），即可进行荧光检测。本方法应用原理为 ExoIII 切割 THF 位点，使荧光与猝灭基团分离，报告荧光信号。
特别说明：
（1） 以上 RPA 扩增测试属于蛋白功能性测试，按照以上实验操作流程，可获得 RPA 扩增产物。进一步的优化，包括：X、Y、GP32、聚合酶、反应 Buffer，甚至加样顺序，均可能进一步提高 RPA 的扩增性能。
（2）关于 DNA 聚合酶的选择， 测试了三种常见的 DNA聚合酶，在进行荧光法测定时，推荐的选择顺序依次为 Bst 4.0>Bsu> Sau，且在 42℃条件下，总能获得最快的扩增速度，且荧光信号更强。在 Basic 扩增中 Sau 表现出特异性扩增能力更佳。
（3）关于 RPA 的灵敏度与非特异扩增，在 Basic 试剂的扩增中，仍然存在非特异扩增产物，这需要进一步优化反应组分及引物序列。在使用荧光探针法时，但由于特异性探针的存在，非特异扩增产物通常无荧光信号值，但此时会影响检测灵敏度。GP32 蛋白的
浓度增加会显著降低非特异性扩增，但会导致扩增速度减缓，此时需要同步增加 X 与 Y 蛋白的用量，以维持 RPA 的扩增速度。
（4）据文献报道，在进行试纸条 RPA 实验时，倾向使用 Nfo 内切酶又名 Endonuclease IV， 来对扩增探针进行切割，但  未予测试，目前无法提供相应参数。
（5）RPA 反应 Buffer 对扩增至关重要，轻微的浓度差异，均可导致扩增效率大幅下降，甚至失败。RPA BufferMix 为粘稠试剂，使用时务必保证加样准确，Tip 头中的残液务必完全打入 EP 管中。

PCR反应基本步骤：
一般的聚合酶链式反应由20到35个循环组成，每个循环包括以下3个步骤：
变性(Denaturation)：
利用高温（93-98℃）使双链DNA分离。高温将连接两条DNA链的氢键打断。在第一个循环之前，通常加热长一些时间以确保模板和引物完全分离，仅以单链形式存在。该步骤时间1-2分钟，接下来PCR仪就控制温度进入循环阶段。
退火或称接合,复性(Annealling)：
在DNA双链分离后，降低温度使得引物可以结合于单链DNA上。此阶段的温度通常低于引物熔点5℃。错误的退火温度可能导致引物不与模板结合或者错误地结合。该步骤时间1-2分钟。
延伸(Extension)：
DNA聚合酶由降温时结合上的引物开始沿着DNA链合成互补链。此阶段的温度依赖于DNA聚合酶。该步骤时间依赖于聚合酶以及需要合成的DNA片段长度。传统的Taq估计合成1000bp/min、较新的Tbr（来自于嗜热菌Thermus brockianus）约40秒、商业公司生产的融合型聚合酶仅需约10-15秒。
 

PCR 反应需要使用哪些试剂？
一、模板DNA：PCR反应需要模板DNA，如从细胞、组织、血液中提取DNA等；
二、引物：PCR反应的两个引物，分别与模板DNA的两端配对扩增所需的特定区域，引物也可以合成为TA克隆等过程中使用到的引物；
三、dNTPs：PCR反应中需要四种dNTPs，包括脱氧腺苷酸（dATP）、脱氧胸苷酸（dCTP）、脱氧鸟苷酸（dGTP）、脱氧胞嘧啶酸（dTTP），用于细胞分裂、DNA合成等生物学过程，用于PCR扩增的模板DNA链的延伸和扩增；四、Taq DNA聚合酶：PCR反应需要的聚合酶，一般使用Taq聚合酶，还有一些其他种类的聚合酶如PFU、Phusion等，用于扩增DNA链；
五、PCR buffer溶液：对PCR反应具有缓冲作用，调节反应pH，硫代硫酸氢盐SDS、小分子有机化合物如甲醛，可增强PCR反应特异性，从而提高反应效率；
六、酶切体系：PCR扩增往往涉及到重组、构建和测序等等实验步骤，常常需要进行酶切操作。
七、MARK:一种分子量标准，用来判别DNA片段大小的工具。
八、DNA纯化试剂盒：用于纯化PCR反应产物；


 
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