E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒

E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒

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  • ¥11500
  • 爱必信(absin)
  • 上海
  • abs60552
  • 2025年07月12日
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  • 企业认证

    • 详细信息
    • 技术资料
    • 保存条件

      试剂盒应在-20℃条件下保存,有效期为 12 个月。开封后未使用完的试剂盒注意仍在规定储存条件下保存。

    • 保质期

      试剂盒应在-20℃条件下保存,有效期为 12 个月。开封后未使用完的试剂盒注意仍在规定储存条件下保存。

    • 英文名

      -

    • 库存

      现货

    • 供应商

      爱必信(上海)生物科技有限公司

    • CAS号

      -

    • 规格

      100T

    概述  
    描述 以质粒/Minicircle DNA为代表的DNA产品可以作为DNA疫苗产品的主要成分之一,也可作为病毒载体或DNA载体基因疗法的重要原料,病毒载体或非病毒载体细胞免疫疗法的重要原料。这些DNA产品的RNA残留可能影响其生物学活性(如干扰质粒的转染、表达效率)或造成风险(如外源RNA可激活细胞干扰素通路引发免疫反应),因此需建立DNA产品的RNA残留定量检测方法。
            本试剂盒配套有E.coli RNA定量参考品可快速准确定量检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中E.coli(DH5α、BL21等)宿主细胞RNA残留量。
            建议所有使用该试剂盒的实验室按需可做以下验证:标准品线性、 样本线性、 准确度(加标回收率)、定量限、精密度(重复性)、 分析特异性以及阴性参考品符合率。 
            样本线性:依据 YY/T 1182-2020 的相关要求,在线性范围内,取接近线性范围上限的高值样本按一定比例(如 5 倍或 10 倍)稀释为至少 5 种浓度,其中低值浓度样本须接近线性范围的下限,将每一浓度样本检测 1 次或多次,计算每一浓度的对数均值和稀释比例(或理论浓度)的对数值,以浓度的对数均值为 Y,稀释比例(或理论浓度)的对数值为 X 进行线性拟合,计算其线性相关系数 r。 
            分析特异性验证:验证需避免工艺杂质对检测结果的干扰,必要时可对样本进行核酸提取纯化。为避免基质干扰和保证检测有效性建议使用纯度较高的 DNA 进行相应稀释后来做验证。 
            精密度/定量限:验证时,如需同时配制标曲,需控制 CV,避免重复操作过多,CV 偏大影响标曲建立和精密度/定量限验证。 
            数据分析:由于仪器不同,数据阈值线会存在区别,故在数据分析时需依据实际情况统一阈值线再进行数据分析比较。 
            样本核酸提取纯化:可与“宿主细胞残留 DNA(磁珠法)样本前处理试剂盒”配合使用。该试剂盒主要用于生物制品样本中微量核酸的提取,可精准抽提各种生物制品中宿主细胞残留 DNA,适 用于多种基质缓冲溶液,可有效提取纯化微量的 DNA。
    产品特点:
    本试剂盒利用荧光探针原理,可定量检测样品中E.coli 残留RNA。检测快速,专一性强,性能可靠,试剂盒线性范围为:200 pg/μL~0.002 pg/μL,最低检测限为2 fg/μL。
    产品性能指标:
    线性范围:200 pg/µL-0.002 pg/µL。  
    标准品线性:R2≥0.980,扩增效率 90%≤Eff(%)≤110%,各浓度检测值 CV<15%。 
    样本线性:依据 YY/T 1182-2020 的相关要求,在线性范围内,取接近线性范围上限的高值样本按一定比例(如 5 倍或 10 倍)稀释为至少 5 种浓度,其中低值浓度样本须接近线性范围的下限,将每一浓度样本检测 1 次或多次,计算每一浓度的对数均值和稀释比例(或理论浓度)的对数值,以浓度的对数均值为 Y,稀释比例(或理论浓度)的对数值为 X 进行线性拟合,计算其线性相关系数 r。  
    准确度(加标回收率):70%-130%。 
    定量限:0.002 pg/µL,CV≤20%,测量偏差不大于|±20%|。  
    精密度(重复性):高、低两个浓度参考品各 10 次,变异系数 CV<15%。
    阴性参考品符合率:比标准曲线中最低点高 2~3 个 Ct 值左右。  
    适用机型(包括但不限于):ABI QuantStudio 3 Real-Time PCR System;ABI 7500 Real-Time PCR System;Bio-Rad CFX Opus 96 Real-Time PCR System。 
    冻融稳定性:5 次以上。
    产品组成
    编号 组成 规格 储存条件
    1 E.coli RNA Primer&Probe MIX 1050µL -20℃避光保存
    2 One Step qRT-PCR Reaction MIX 420µL -20℃
    3 One Step Enzyme MIX 105µL -20℃
    4 E.coli RNA 定量参考品(20 ng/µL) 50µL -20℃
    5 RNA 稀释液 1.5mL×3 -20℃
    用途说明 本试剂盒配套有 E.coli RNA 定量参考品可快速准确定量检测各种生物制品的中间品、半成品和成品中 E.coli(DH5α、BL21 等)宿主细胞 RNA 残留量。
    使用方法 一、准备工作:
    1、试剂盒准备: 
    将试剂盒各组分置于冰上或 4℃,确保充分溶解后开始操作。
    2、需自备的试剂:
    DNase Ⅰ(RNase-free)
    3、需自备的耗材及设备: 
    (1)荧光定量 PCR 仪、涡旋仪、离心机 
    (2)高精度移液器及一次性无菌无酶低吸附带滤芯吸头(0.5-10µL、10-100µL、20-200µL、100-1000µL) 
    (3)1.5mL 无菌无酶低吸附离心管 
    (4)无菌无酶八联管或 96 孔 qPCR 板
    二、操作流程 :
    1、操作详细步骤 
    (1)待测样品的前处理: 
    样品中残留 RNA 的提取纯化可采用宿主细胞残留 DNA (磁珠法)样品预处理试剂盒(abs60544)。待测样品在检测前需要进行 DNase 处理以消除 gDNA 对检测的影响。DNase 用量和消化条件需按 DNase 的使用说明以及实际样品进行优化。 
    建议设置加标样品,与待测样品进行同步处理,作为回收率考察。 
    (2)qRT-PCR 反应液的制备: 
    ①根据所需检测的参考品和待测样品数量(一般做 3 组复孔),分别计算各片段反应所需孔数: 
    反应孔数=(参考品 ST1-6 +1 个无模板对照 NTC+待测样品)×3
    ②根据反应孔数计算本次所需的 E.coli RNA qRT-PCR MIX 总量: 
    E.coli RNA qRT-PCR MIX =(反应孔数+2 或 3)×4 μL(One Step qRT-PCR Reaction MIX)+(反应孔数+2 或 3)×1 μL(One Step Enzyme MIX)+(反应孔数+2 或 3)×10 μL(E.coli RNA Primer&Probe MIX)(2 或 3 为操作损失量) 
    ③将所用试剂置于冰上完全溶解,轻微振荡混匀,瞬时离心,按表 2 所示配制 E.coli RNA qRT-PCR MIX。
    表 2 qPCR MIX 配制表
    组分 单个反应量
    E.coli RNA Primer&Probe MIX 10μL
    One Step qRT-PCR Reaction MIX 4μL
    One Step Enzyme MIX 1μL
    总体积 15μL

        ④将配制的 qRT-PCR MIX,轻微振荡混匀,瞬时离心,按 15μL/孔分装至八联管或者 96 孔板中。 
        ⑤将RNA稀释液按5μL/孔加到分装了 qRT-PCR MIX 八联管或者 96 孔板中,具体加样见表 4。 
    (3)定量参考品的稀释: 
    (注:根据试剂盒提供的标准品按照需求配制) 
    用试剂盒提供的 RNA 稀释液将 RNA 定量参考品(20ng/μL)系列倍比(稀释倍数:10 倍)稀释,稀释浓度依次为 2000 pg/μL,200 pg/μL,20 pg/μL,2 pg/μL,0.2 pg/μL,0.02 pg/μL,0.002 pg/μL。 
    具体步骤如下: 
    ①将试剂盒中的 RNA 定量参考品和 RNA 稀释液置于冰上或 2-8℃条件下融化。待完全溶解后,轻微振荡混匀,离心 3~5 s。 
    ②取干净的 1.5 mL 离心管,分别标记为 ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6。 
    ③在 ST0 管中用 RNA 稀释液将 RNA 定量参考品(20ng/μL)稀释至 2000 pg/μL,轻微振荡混匀,离心 3~5 s。确保 RNA 定量参考品与RNA 稀释液充分混匀,使用时避免反复冻融。 
    ④在 ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6 管中分别加入 90μL RNA 稀释液,再进行梯度稀释,稀释方法如下所示:
    表 3 DNA 定量参考品的稀释
    稀释管 稀释体积 终浓度(pg/μL)
    ST1 10 μL ST0+90 μL RNA 稀释液 200
    ST2 10 μL ST1+90 μL RNA 稀释液 20
    ST3 10 μL ST2+90 μL RNA 稀释液 2
    ST4 10 μL ST3+90 μL RNA 稀释液 0.2
    ST5 10 μL ST4+90 μL RNA 稀释液 0.02
    ST6 10 μL ST5+90 μL RNA 稀释液 0.002
    E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒

    【注】:标准曲线浓度点可根据实际验证结果进行选择,应至少包含 5 个浓度点。
    已融化未使用的 DNA 稀释液可在 2-8℃短暂保存,若长期不使用,请储存于-20℃。 稀释方法可根据实验需要进行调整。
    (4)qPCR-PCR 加样:
       将所需试剂置于冰上操作,轻微振荡混匀,瞬时离心,按表4所示加样:
    表 4  各反应孔加样示例

    参考品 ST1-6 各 5 μL+所需 E.coli RNA qRT-PCR MIX 量 15 μL
    无模板对照NTC RNA 稀释液各 5 μL+所需 E.coli RNA qRT-PCR MIX 量 15 μL
    待测样品 待测样品各 5 μL+所需 E.coli RNA qRT-PCR MIX 量 15 μL

    【注】:无模板对照 NTC 为防污染,在反应液配制时已经加样完成。
    (4)qPCR 反应程序参数设置:
    以美国 ABI 7500 Real-Time PCR System、软件版本 2.06 为例。
           1)在Experiment Propertie s 页面创建空白新程序如图所示 :
    E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒

    ①Experiment name:修改实验名称。
    ②Experiment type: 选择程序(Quantitation-Standard Curve)。
    ③Reagents:选择实验方法(TaqMan ® Reagents )。
        2)创建该产品检测探针,选择E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒①界面,点击E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒②创建探针,在TargetName中编辑探针名称分别命名为 E.coli-RNA,在Reporter③和Quencher④中选择所需的荧光基团和淬灭基团。本产品荧光基团选择FAM,淬灭基团为None(参比荧光为ROX)。点击E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒⑤创建样品,在相应的Samplename⑥一栏中命名样品的名称。
    E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒

        3) 在 Plate SetupE.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒 ①界面,将标准曲线孔在 Task② 一栏设置为“S”③,并且在 Quantity④一栏分别赋值设为 200,20,2,0.2,0.02,0.002(单位为 pg/μL),并且在相应的 Sample name 一栏中命名为ST1,ST2,ST3,ST4,ST5,ST6。在 Plate SetupE.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒 ①界面中,将无模板对照 NTC 孔在 Task②一栏设置为“N”⑤,将待测样本孔在Task②一栏设置为“U”⑥,并且在相应的 Sample name 一栏中命名样品的名称。(图例仅供参考)
    E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒

         4) 设 置 反 应 程 序 :

    Stage1 污染消化 Reps:1 55℃ 15min

    程序中 60℃ 34s 处设置为荧光收集①; 反应体积 20μL。

    Stage2 预变性 Reps:1 95℃ 30s
    Stage3 循环反应 Reps:45 95℃ 10s
    60℃ 34s
    E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒

          5) 点 击 Run 界 面 的 “Start Run”按 钮 进 行 PCR 测 定 。

    三、结果分析:
    以美国 ABI 7500 Real-Time PCR System、软件版本 2.06 为例。
    1、在 Analysis 的 Amplification Plot①面板中,点击 Reanalyse②,初步查看扩增曲线的形态是否正常。在 Analysis 的 Standard Curve③面板中,可读取标准曲线的斜率(Slope)、R 2和扩增效率(Eff%)④等。在 Analysis 的 View Well Table⑤面板中,Quantity Mean 一栏可读取待测样本的检测值,单位为 pg/μL。(图例仅供参考)
    E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒
    E.coli总RNA残留(qPCR)检测试剂盒

    2、结果分析的参数设置需依据具体的机型及使用的软件版本,一般也可由仪器自动判读。

    性能  
    储存/保存方法 试剂盒应在-20℃条件下保存,有效期为 12 个月。开封后未使用完的试剂盒注意仍在规定储存条件下保存。
    注意事项 1、本试剂盒已通过稳定性(冻融等因素)的验证,无需分装。 
    2、对样本前处理后,需要进行 DNase 处理以消除 gDNA 对检测的影响
    3、阴性样品(E.coli RNA Primer&Probe MIX、One Step qRT-PCR Reaction MIX、One Step Enzyme MIX、RNA 稀释液)和阳性样品(参考品和待测样品等)的配制环境需区分区域,不可在一个区域内操作,配制人员需穿戴整齐,戴好口罩、手套和穿好洁净服。 
    4、因为 RNA 容易被 RNA 酶降解,在涉及 RNA 的相关操作实验以及操作环境中需避免 RNA 酶的使用。如质粒提取过程中会涉及 RNA 酶的使用,则 RNA 检测时需避开其相关操作环境。 
    5、注意在不同加样步骤间及时更换吸头,避免交叉污染,避免长时开盖,使用移液器移液时,需避免液体挂壁。 
    6、试剂盒必须在有效期内使用,每次实验均需重新制备相应的标准曲线,不建议不同标准曲线之间混用,不建议不同批次的相关试剂混用。 
    7、试剂盒内所有组分建议在低温环境融化后使用,且需确保其充分溶解,各组分使用前需充分混匀,以保证试剂的均一性,经混匀的试剂需经短暂离心,以使管壁及盖子上的液体全部集中于管底。 
    8、操作过程建议在冰上进行。 
    9、只有严格遵守说明书的操作方法,全部使用本试剂盒配套的试剂才能保证最佳检测效果。 
    10、最终的实验结果与试剂的有效性、操作者的操作方法及实验环境密切相关。
    11、公司只对试剂盒本身负责,不对因使用该试剂盒所造成的样本消耗负责,请使用者使用前充分考虑到样本的可能使用量,预留充足的样本。

    风险提示:丁香通仅作为第三方平台,为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全,合理判断,谨慎选购商品,商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品,请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。

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