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信帆生物
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文献和实验诺奖得主 Science 发文:基因编辑诞生 10 年,未来将如何改变世界?
精度 ≥ 50%。 为了减少 CRISPR-Cas 核酸酶因意外结合切割而产生的脱靶效应,目前通过使用高保真 CAS 变体和合理设计去氨基酸结合结构,以减少不依赖 Cas 的核酸结合。同时,使用新方法将 CAS 编辑器递送到目标位点并优化现有编辑器可以同时尽量减少脱靶效应。 此外,将碱基编辑器融合到 Gam(来源于噬菌体 Mu 蛋白,可以结合在 DNA 双链断裂的末端,保护 DNA 不被降解) 可以最大限度地减少碱基编辑过程中的 indel(插入缺失)形成。 编辑精度面临着更
北大伊成器团队 Nature Method 发文,揭示单碱基编辑脱靶风险!
后,相应的测序信号都出现了极大的降低。这些结果都表明了 CBE 脱靶效应的存在。 作者对脱靶现象进行了进一步细分,发现这些脱靶现象发生的靶点可以被分为 Cas9 依赖性以及 Cas9 非依赖型。 图片来源:Nature Method 为了验证 Detect-seq 的可靠性,作用将 Detect-seq 与此前被用来研究 Cas9 依赖型脱靶效应的工具进行了对比。与 GUIDE-seq 相比,Detect-seq 识别出了大部分 GUIDE-seq 在 EMX1 与 VEGFA_site_2 中识别
Nature:哈佛大学董民团队利用昆虫细胞全基因组 CRISPR 筛选,揭示杀虫毒素受体
细菌蛋白毒素是很多致病菌的主要武器,例如白喉毒素,炭疽毒素,肉毒杆菌毒素等等。近年来,全基因组 CRISPR/Cas9 筛选技术在哺乳动物细胞上得到广泛应用,成为研究这些针对人和动物的毒素和病原菌的主要实验方法。昆虫是地球上种类最繁多的动物,在整个生态链上起到至关重要的作用。在自然界中,存在许多专门靶向昆虫的细菌蛋白毒素, 有些已经被广泛地应用于农业害虫防治 。 现有的 CRISPR-Cas9 筛选技术依赖针对哺乳动物细胞的慢病毒转染系统,不适用在昆虫细胞上,大大限制了人们对针对昆虫的蛋白
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