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RNA Seq Library Prep Kit
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北京百奥创新科技有限公司
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BioDynami RNA Seq建库试剂盒
产品简介:
BioDynami开发了RNA Seq建库试剂盒,用于构建高质量的二代测序文库(illumina和MGI平台)。RNA测序是分析转录组的一个非常强大的工具,如基因表达和转录调控、剪接鉴定、突变和变异检测等。该试剂盒需要纯化的RNA(例如:去除rRNA的RNA或polyA mRNA)作为文库构建的输入。库多路复用可以使用不同类型的索引。

RNA Seq建库试剂盒工作流程
illumina平台试剂盒有三种index类型:
Non-index(illumina Cat.# 30055):没有索引。
Index(illumina Cat.# 30056):每个引物都包含6个碱基的独特序列。RNA测序文库复用可用于多达48个样本。
Unique dual index(illumina Cat.# 30057):使用独特的双索引,可实现多达96个样本的RNA测序文库复用。建立了4-Base Difference Index System。该系统可以在8个碱基索引区域生成至少4个不同于其他碱基的索引。独特的双索引引物可识别测序错误,如索引跳变、分配错误和解复用错误。
MGI平台试剂盒(Cat.# 34112)亦适用上述index类型。
试剂盒特性:
★ 快速的实验方案
★ 保证质量
★ 工作流程简单
★ 输入纯化RNA量:从3 ng到100 ng
★ 文库将在两小时内准备就绪
★ 操作时间只有大约10分钟
★ 高收益
★ 模式统一

实验时间的比较:BioDynami RNA Seq Library Prep Kit与其他厂商的试剂盒。记录了操作时间和离开时间。

BioDynami试剂盒文库大小及分布,输入polyA mRNA 20 ng和3 ng。

相同条件下文库产量和重复率的比较:以20 ng和3 ng的polyA mRNA作为输入。测定PCR周期数。

比较转录本的覆盖率:20 ng的polyA mRNA作为输入。BioDynami试剂盒覆盖范围更均匀。
产品订购:
| 产品名称 |
货号 |
产品规格 |
| RNA Seq Library Prep Kit |
30055S |
non-index,24 reactions |
| RNA Seq Library Prep Kit |
30055L |
non-index,48 reactions |
| RNA Seq Library Prep Kit |
30056S |
index,24 reactions |
| RNA Seq Library Prep Kit |
30056L |
index,48 reactions |
| RNA Seq Library Prep Kit |
30057S |
unique dual index,96 reactions |
| RNA Seq Library Prep Kit |
30057L |
unique dual index,192 reactions |
| RNA Seq Library Prep Kit |
34056S |
index,24 reactions |
| RNA Seq Library Prep Kit |
34056L |
index,96 reactions |
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文献和实验如Corall total RNA seq library preparation kit,这一点可以忽略)。 利用所选的RNA样本和文库生成引物进行逆转录进行一链合成。 然后通过沿cDNA链随机引物进行第二链合成。 进行末端修复,接头连接。 最后进行PCR扩增,为文库添加index,或文库扩增以以获得足够量的文库,以及进行文库质量控制。 Lexogen mRNA-Seq文库准备与其他全转录组测序文库制备方法略微不同。在Lexogen mRNA-Seq文库准备中
可以分析半衰期小于10min的瞬时增强子、反义和启动子相关的RNA,此外也可以确定转录终止位点。 SLAM-seq 优点:无需免疫共沉淀或生物素分离导致的结果的偏差,操作简单,RNA input量少;可结合Quantseq 3’mRNA建库试剂盒使用,节省大量的测序空间,大大节约测序成本。 相对于其他的方法,SLAM-seq(图3)表现超强的优势,无需繁琐且技术要求苛刻的免疫共沉淀或生物素分离等操作,操作简单,RNA
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