质谱服务-蛋白质质谱鉴定技术服务

 

质谱服务-蛋白质质谱鉴定技术服务-详情

单一蛋白质或者蛋白混合物的蛋白质谱鉴定/分析，以及对单一蛋白质的蛋白序列分析是生物学研究中经常遇到的问题。基于质谱法获取蛋白质序列的序列信息以及通过质谱法进行蛋白质质谱鉴定，蛋白质谱分析从而实现蛋白质鉴定，即protein identification，基于LC-MS的蛋白质谱鉴定。常见分析包括：翻译后修饰位点分析等。

百泰派克生物科技使用Thermo公司zuì新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪结合Nano-LC纳升色谱技术，能够对蛋白质提取物、SDS-PAGE蛋白条带、2D蛋白胶点、pull-down及Co-IP等样品中的蛋白质进行高效精准的蛋白质谱鉴定服务。

百泰派克可提供以下蛋白质质谱鉴定服务：

1. 对纯化蛋白进行蛋白质质谱分析/质谱鉴定；

2. 对蛋白胶点，蛋白质胶条质谱鉴定，蛋白银染胶质谱鉴定，考染/荧光/Zn/Cu2+等类型染色的胶点/胶条样品进行鉴定；可参见：蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定服务；

3. 对pull-down蛋白质谱鉴定、IP蛋白互作的IP-MS互作蛋白鉴定、Co-IP质谱验证互作蛋白，免疫共沉淀结合质谱验证，等简单混合物样品中的蛋白样品进行蛋白质鉴定/分析；

4. 对复杂样品中的未知蛋白质进行蛋白质谱分析/蛋白质谱鉴定。即使是非常低浓度的蛋白样品也可能通过蛋白质谱鉴定。

对于单一蛋白质和简单蛋白混合物的鉴定，我们保证100%的鉴定率，否则不收任何费用。

NanoLC-MS/MS分析简单或复杂混合物中的蛋白质质谱分析。样品可以是来自于SDS-PAGE凝胶中的条带或蛋白点，也可以是溶液样品。（我司也提供1D 或2D SDS-PAGE服务，点击了解详情。）

百泰派克基于质谱的蛋白鉴定示例

百泰派克基于质谱的蛋白质质谱鉴定流程:

样品前处理

shǒu先，用二硫苏糖醇（DTT）还原蛋白质样品，用碘乙xiānàn（IAA）wán基化。然后用胰蛋白酶对样品进行消化，一般样品会在赖氨suān和精氨suān残基后发生断裂。zuì后，冻干得到多肽片段。

上机分析

将样品用NanoLC的A相重新溶解后上样，在NanoLC-MS/MS系统下分析。

数据库检索

根据样品物种来源从UniProt下载对应物种的蛋白质组数据库，使用MaxQuant、Proteome Discoverer、Peaks等软件将液质联用得到的数据与数据库中数据进行匹配，通过肽段的一级和二级碎片的质量在数据库中找到匹配的蛋白质，从而鉴定样品中的蛋白质。

如果样品的物种还没有完整的蛋白质组数据库，我们将使用亲缘较近物种的蛋白质组数据库或者是同种模式生物的蛋白质组数据库进行蛋白鉴定分析。

出具报告

鉴定报告中会包括详细的样品前处理步骤，色谱-质谱平台参数，以及鉴定得到的蛋白质列表和肽段列表。质谱原始数据会通过网盘形式提供。

您只需把您的样品收集后提供给我们，后续所有步骤均由我们完成。百泰派克公司基于质谱的蛋白质质谱鉴定/质谱分析服务包括：样品前处理-蛋白还原wán基化后使用高度特异性的蛋白酶进行蛋白样品消化，获得多肽片段；上机分析-通过纳升级色谱（nano-flow）结合高分辨率质谱，在zuì高的灵敏度下对肽段进行分离并使用超高分辨率质谱仪采集肽段质谱数据；数据库检索-结合样品物种对应的蛋白质数据库对成千上万张质谱图进行分析（使用Uniprot数据库，每月更新一次数据库，以确保访问zuì新数据），从而实现样品中蛋白的蛋白质质谱鉴定；到zuì后出具样品报告，均由百泰派克公司一站式完成：

1. 客户提供了包含一种或多种蛋白质的样品，如胶条，胶带，溶液或固tǐ样品，pull-down或Co-IP样品。

2. 百泰派克公司根据样品情况，选择合适的酶，对来样进行蛋白酶消化，然后进行nanoLC-MS/MS分析。

3. 对获取的数据进行搜库分析。

4. 在10-15个工作日内收到报告。

*如果您的样品中含有洗涤剂/裂解剂，请在送样单中注明。

 

联系我们

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服务项目

蛋白分析

蛋白鉴定	分子量测定	肽质量指纹图谱分析
基于埃德曼降解的蛋白质N端测序	Pull-down靶蛋白质谱鉴定	Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定
蛋白测序	蛋白质N/C端测序	蛋白全序列测定
标记转移法蛋白相互作用分析	单克隆抗体从头测序	蛋白从头测序和突变分析
SILAC与免疫共沉淀质谱联用	蛋白质相互作用分析	蛋白质相互作用质谱分析
GST pull-down	蛋白质质谱鉴定	交联法蛋白相互作用分析
蛋白质结构鉴定	抗体测序	蛋白质圆二色谱分析
膜蛋白鉴定服务	序列分析	多肽测序
多肽从头测序	CO-IP免疫共沉淀法	Far-Western Blot分析
蛋白质一级结构的测定

蛋白质组学

定量蛋白质组学	Label Free	iTRAQ, TMT, SILAC
半定量蛋白质组学	2D-DIGE定量蛋白质组学	SWATH定量蛋白组学
MRM/PRM定量蛋白组学	4D蛋白质组学	多肽组学
多肽质谱鉴定	多肽生物标志物鉴定	翻译后修饰蛋白组学
糖基化定量蛋白组学研究	乙酰化定量蛋白组研究	泛素化定量蛋白组学研究
组蛋白翻译后修饰分析	酰化定量蛋白质组研究	甲基化定量蛋白组学研究
蛋白质SUMO化鉴定	基于Top down自上而下	法的PTMs表征
糖蛋白组学	绝对定量分析（AQUA）	肽纯度分析
DIA定量蛋白质组学	靶向蛋白质组学	S-亚硝基化分析
基于高精度质谱的免疫	蛋白二硫键鉴定和定量分析	磷酸化定量蛋白组学研究
多肽组学分析及新抗原发现

代谢组学

非靶向代谢组学	靶向代谢组学	氨基酸及其衍生物
肉碱和酰基肉碱类	植物激素	胆汁酸
动物激素	脂肪酸及脂肪酸代谢	ATP代谢相关物质分析
白藜芦醇	木酚素	多酚
生物胺	有机酸	类胡萝卜素
核苷酸及相关物质分析	短链脂肪酸	脂质代谢组学
离子组学	未知代谢物鉴定	源性代谢物分析
糖类及糖代谢	维生素与辅酶	NAD代谢相关物质分析
氧化型胆固醇	脂质组学MALDI成像服务	代谢通量分析
黄酮

多组学整合分析

脂质组学+蛋白质组学	转录组学+代谢组学	转录组学+蛋白质组学
蛋白质组学+代谢组学	翻译后修饰蛋白质组+代谢组	转录组学+脂质组学

生物药物表征

非变性质谱分析（Native MS）	抗体偶联药物（ADCs）分析	蛋白质纯度分析（分子筛/反相色谱）
生物药二硫键/游离半胱氨酸检测	肽段覆盖率/肽谱图分析	SDS-PAGE蛋白质纯度分析
高分辨质谱分子量鉴定	抗体C端K缺失比例分析	MALDI TOF分子量分析
生物制药N/C端测序	生物药糖谱检测	蛋白质肽谱图测定
氢氘交换质谱HDX MS	蛋白质等电点测定	宿主蛋白残留(HCP)分析
生物药糖基化位点检测	生物制药N端测序	生物药氨基酸组成分析

单细胞分析

单细胞质谱流式技术

单细胞测序

检测平台

基于生物化学、分子生物学、色谱的检测分析平台：该平台配备了Agilent 2100 生物分析仪、 ProteinSimple凝胶成像系统、高效液相色谱系统，为蛋白质组学、代谢组学分析保驾护航，包括样品制备、分离纯化、分子量测量、杂质表征表达研究等；

基于质谱技术的蛋白质组学分析平台、代谢组学分析平台、蛋白测序平台：该平台配备了超高效液相色谱质谱联用，Orbitrap Fusion Lumos Tribri，Thermo Scientific Exploris以及氢氘交换质谱仪配合机械臂为蛋白质组学、代谢组学和蛋白测序提供了全面的分析手段，包括蛋白质和代谢物的分离、质谱分析、结构分析以及动态信息研究；

生物药物表征平台： 该平台配备了DSC-FTRR差示扫描量热仪与傅立叶变换拉曼光谱仪，氢氘交换质谱仪配备机械臂，为生物药物表征提供了全面的分析手段，包括生物药物的分离、纯化、结构分析和动态信息研究；

基于10x Genomics的单细胞分析平台：该平台能够完成基于10x Genomics单细胞分析平台的检测流程，包括单细胞分选、cDNA合成、文库制备、文库质量检测、PCR扩增以及高通量测序；

基于Fluidigm的单细胞质谱流式检测平台：采用基于Fluidigm Helios流式细胞仪（Mass Cytometry System for Single Cell Analysis）用于单细胞质谱分析，该平台能够完成包括单细胞捕获、cDNA合成、实时定量PCR分析、目标区域扩增以及质谱流式细胞分析；

基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台：基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台，能够完成包括多肽分离、纯化、合成、质谱分析、免疫学检测以及分子相互作用研究；

生信云平台：基于生物信息分析方法的生信云平台，能够完成一整套的生物信息学解决方案，包括组学数据的质量分析、差异表达分析、差异表达物GO、KEGG、COG注释分析、聚类分析、相互作用网络等多层次网络和通路的分析。

 

特色项目

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一、蛋白测序

蛋白测序服务两种主要分析方法

E蛋白测序服务两种主要分析方法：埃德曼降解（Harvey和Ferrier，2011； Bauer等，1997）和质谱分析（MS）（Sahukar等，2016）。蛋白质测序和鉴定常用质谱法，埃德曼降解法是表征蛋白质N端重要的方法之一。

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

蛋白测序服务流程

蛋白测序服务优势

1 .采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

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二、蛋白质组学

蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析，我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”，它们可成为新药物设计的分子靶点，或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实，那些世界范围内销路好的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此，蛋白质组学研究不仅是探索生命奥秘的必须工作，也能为人类健康事业带来巨大的利益。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

不同技术的比较

蛋白质组学服务	特点	技术要点
Label-free	非标蛋白质组学	无需对样品标记处理； 操作简单； 可大规模分析蛋白质鉴定样品，对样品数量无限制。
iTRAQ/TMT	体外标记定量蛋白质组学	可同时定量分析 2-10 个样品； 体外标记，不受样品类型限制； 可鉴定多达6000个蛋白； 实验稳定度和重复度较高。
SILAC/Dimethyl	体内标记定量蛋白质组学	可对比23 个样品； 体内标记，标记稳定，组间误差小； 需要的样本量较小，仅需几十微克的蛋白。
SWATH	DIA 全景蛋白质组学	全景式、高通量、非质谱依赖的数据采集手段； 数据采集精准高效，线性范围； 检测蛋白丰度跨越 4个数量级； 可分析多达 2000 个蛋白质。
MRM	绝对定量蛋白质组学	基于已知质谱信息来对目标分子进行分析的手段； 检测精准高效，可进行绝对定量分析； 实验结果重现性好，准确度高； 可精准鉴定低丰度蛋白。

蛋白质组学服务优势

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

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三、单细胞质谱流式技术分析

单细胞质谱流式（Mass Cytometry）技术利用质谱技术对单细胞进行多参数检测，既有传统流式细胞术能够高速分析的特点，又兼并了质谱检测的高分辨能力。能够指定检测蛋白，避免漏掉丰度很低但又很重要的蛋白，且质谱流式技术通量相当高，可以实现大量细胞的检测。

百泰派克生物科技单细胞质谱流式分析方案

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

单细胞质谱流式服务优势

①技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

②分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

③应用前景大

a)流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

b)将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

c)可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

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四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现分析策略

结果交付

1.所有鉴定的免疫多肽列表，新抗原肽以及肿瘤相关抗原肽列表；
2. 免疫多肽组数据质量分析，如研究案例中的数据报告。

 

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五、生物药物表征

生物制药是通过现代医学研究手段结合生物生产技术研发生物医药技术产品，主要包括蛋白质、多肽、抗体、疫苗，以及生物诊断试剂等产品。近年来我国的生物医药领域一直保持着稳定发展速度，也一直占据着生物研究的热点。但是生物制品由于生物过程复杂，影响因素众多，使得生物制品在生产过程中可能引入新的杂质，或者造成生物制品本身结构性质变得不均一。这些因素可能削弱生物药物的疗效，甚至造成生物毒性和机体免疫反应等不良结果。所以生物药物在进入临床测试之前必须经过一系列严格检测来确定生物药物是否合规。百泰派克了解生物制药领域开发所面临的挑战，专注于提供完整的生物药物鉴定和分析服务。

 

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

生物药物表征服务内容

生物药物鉴定服务	产品变异性分析	生物药物纯度分析
高分辨质谱分子量	生物药糖谱检测	SDS-PAGE蛋白质纯度分析
MALDI TOF分子量分析	生物药糖基化位点检测	宿主蛋白残留（HCP）分析服务
生物制药N端测序	生物药二硫键/游离半胱氨酸检测	蛋白质纯度分析（分子筛/反相色谱
生物制药N/C端测序	抗体C端K缺失比例分析	抗体偶联药物（ADCs）
肽段覆盖率/肽谱图分析
蛋白质肽谱图测定
生物药氨基酸组成分析
氢氘交换质谱HDX MS
蛋白质圆二色谱分析

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百泰派克生物科技-生物药物表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。
1、公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；
2、获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；
3、业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；
4、7大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；
5、服务3000+企业，10000+客户的选择；
6、致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!