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单细胞测序
免疫组库(scVDJ-seq)
免疫组库(immune repertoire,IR) 是指在任何指定时间,生物个体的免疫系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的总和。这种免疫组库的多样性,具体体现在由V、D、J、C基因区段排列组合形成的B细胞受体(BCR)或T细胞受体(TCR)的多样性上。单细胞免疫组库测序技术(scVDJ-seq),可以在单细胞水平,通过一次实验同时测定成千上万个淋巴细胞克隆的天然VDJ序列及其组合信息。这种单细胞精度、高通量的免疫组库研究方法,极大的提高了相关研究的效率。
原理
其测序原理是利用其测序原理利用微孔板芯片技术,使带有Cell Barcode标记的磁珠与单个细胞靠自身重力沉降 在同一个微孔中。然后在微孔中将细胞裂解,单个细胞释放出的mRNA被磁珠的oligo-dT捕获。随后收集捕获了单细胞 mRNA转录组的磁珠,构建cDNA文库。最终通过cDNA文库序列前的Cell Barcode与UMI序列,判定某一个单细胞的基因表达量。
| 服务名称 | 服务内容 |
| 单细胞转录组测序(WTA) | 在单细胞水平对全mRNA表达谱进行检测 |
| 单细胞靶向转录组测序 | 在单细胞水平对特定的靶向基因进行检测 |
| 人 onco BC pannel | 用于乳腺肿瘤组织研究,可检测389个基因 |
| 人/小鼠 免疫反应 pannel | 用于开展单细胞免疫检测,人(399)、小鼠(397) |
| 人 T细胞 pannel | 用于开展T细胞单细胞检测,可检测259个基因 |
| 定制 pannel | 最多可定制500个相关基因的靶向pannel |
| 细胞表面蛋白检测(Ab-seq) | 在单细胞水平同时检测蛋白和基因表达的多组学研究 |
| 单细胞免疫组库测序 | 富集TCR/BCR基因并测序,实现免疫组库多样性检测 |
上海乐备实生物技术有限公司是国内主要专注于提供单/多因子相关检测分析的实验服务专家。我们现有单细胞测序、PCR Array、ELISA,MSD、Luminex、CBA、抗体芯片、流式、Elispot、免疫组化等12个技术平台。通过线下和线上的方式为超过2000个客户提供服务,年检测样本超过120万,受到了广大客户的赞赏。
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文献和实验Clonotype 组成(如增殖性克隆,细胞类型间 clonotype overlap 情况,clonotype 多样性等),样本间 clonotype 组成(同一生物个体不同样本间 clonotype overlap 情况等) 单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近数千个细胞,可在一个样本中同时获5'端 mRNA 表达谱、TCR 和 BCR 的信息,结合基因的表达谱和 V(D)J 数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析。 实验流程 免疫组库测序实验
,clonotype多样性等),样本间clonotype组成(同一生物个体不同样本间clonotype overlap情况等) 单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近数千个细胞,可在一个样本中同时获5'端mRNA表达谱、TCR和BCR的信息,结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析。 实验流程 免疫组库测序实验流程如下: 基于TCR/BCR检测的V(D)J区域靠近5'端,故免疫组库测序所用磁珠标签序列由也单细胞最末端的polydT序列改为TSO序列,构成read
-Sequencing (scRNA-seq) Analysis Outline (Trends Immunol. 2017 Feb;38(2):140-149.)但随着科研要求的不断增高,以及技术手段的不断发展,免疫组库的研究也正逐渐向更精细的方向发展,单细胞免疫组库测序,使得科学家从另一个角度认识这个复杂的系统。单细胞 RNA 测序是分析个体免疫细胞的有力工具,特别是在免疫系统发育和反应过程中。专门用于处理和分析单细胞数据的计算方法可以观察在群体水平无法解决的罕见和中间细胞状态。而 B 细胞和 T 细胞的单细胞
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