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- 环状RNA（circRNA）在真核生物中广泛存在的发现使转录家族又增加了重要一员，lncRNA研究也正如火如荼，复杂的转录、转录调控网络研究如何走捷径？ SBCﾠceRNA芯片是一个“全转录组+”产品，不仅同时检测circRNA、lncRNA等非编码RNA和编码蛋白的mRNA,并同时获得circRNA、lncRNA功能预测结果，为进一步功能研究提供参考。circRNA、lncRNA作为竞争性内源RNA（ceRNA），竞争性结合miRNA，从而调控miRNA靶基因的表达,这样的作用方式广泛存在，ceRNA芯片也同样是ceRNA研究的不二之选。
- 上海浦东新区
- 2026年02月02日
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- 提供商：
生物芯片
- 服务名称：
转录组服务
环状RNA（circRNA）在真核生物中广泛存在的发现使转录家族又增加了重要一员，lncRNA研究也正如火如荼，复杂的转录、转录调控网络研究如何走捷径？ SBCﾠceRNA芯片是一个“全转录组+”产品，不仅同时检测circRNA、lncRNA等非编码RNA和编码蛋白的mRNA,并同时获得circRNA、lncRNA功能预测结果，为进一步功能研究提供参考。circRNA、lncRNA作为竞争性内源RNA（ceRNA），竞争性结合miRNA，从而调控miRNA靶基因的表达,这样的作用方式广泛存在，ceRNA芯片也同样是ceRNA研究的不二之选。
基因芯片作为一个成熟的技术平台，二十几年来被广泛用于基因表达谱的检测。对于lncRNA、circRNA基因表达谱检测，基因芯片比RNA测序有许多重要且不可替代的优势：
1、芯片利用寡核苷酸探针与目的基因碱基互补杂交、扫描获得的荧光信号来检测表达丰度。与RNA测序相比，芯片检测的准确性受低丰度转录本的影响更小，更适合检测整体表达丰度低的lncRNA、circRNA。由于提高测序深度会增加加工不完全RNA的检出机率，提高测序深度可能引起可靠性的下降。
2、lncRNA不具有蛋白的翻译起止位置，RNA测序对lncRNA转录本鉴定的可靠性要低于mRNA。而芯片探针较短可以进行特异性设计，检测更特异。
3、circRNA具有特殊的环状结构，但其线性序列和线性基因难以区分，需要单独的去线性建库才能利用RNA测序来检测circRNA，不能同时检测多种RNA。
SBC是国内较早从事基因芯片研发，也是较早的基因芯片外包服务商之一。SBC根据多年基因芯片开发、设计及对外服务经验，结合lncRNA、circRNA分子特点，专门针对非编码RNA研究设计了可同时检测circRNA、lncRNA等非编码RNA和mRNA的芯片产品以满足科学家的研究需求。芯片委托Agilent公司使用Agilent SurePrint技术生产，技术重复性高于99%。
芯片设计策略
设计收录了circBase数据库的circRNA信息，并针对circRNA反向剪接位点设计特异性circRNA探针。
LncRNA同样收录自新的数据库和高质量文献报道，去除冗余，并通过严格的生物信息学方法剔除lncRNA片段及不可靠的lncRNA。通过CAGE-seq，RNA-seq数据鉴定具有高可信度5’TSS及在多种组织或细胞中的表达量的lncRNA，HGNC收录及lncRNAdb 收集的实验验证功能性的lncRNA作为高可信度lncRNA。
基于earray软件设计探针，并利用SBC自有分析流程对探针进行double-check，保证探针高特异性区分mRNA、circRNA和lncRNA。
Human ceRNA芯片设计流程图
1、一箭三雕--可同时检测circRNA、lncRNA和mRNA
2、circRNA探针设计在反向剪接位点，特异性强
3、技术成熟、灵敏度高：芯片比测序更适合检测表达量低的lncRNA、circRNA
4、实验周期短，数据分析方法成熟、快速
5、收录lncRNA、circRNA全面、可靠，并及时更新
6、功能机制预测，为深入研究circRNA、lncRNA生物学功能提供参考，包括：
· 高保守lncRNA
· lncRNA结合蛋白预测
· lncRNA生物学功能预测
· lncRNA亚细胞定位
· 疾病相关lncRNA预测
· super enhancer lncRNA
· enhancer lncRNA
· 疾病相关circRNA预测
芯片技术参数
样本要求：RNA≥200 ng ； 物种：人、小鼠
■ SBC circRNA芯片
探针设计策略同ceRNA芯片中circRNA探针设计，单独对样品中的circRNA进行检测。
芯片技术参数
样本要求：RNA≥200 ng ； 物种：人、小鼠
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文献和实验在生命科学的不同研究中，需要观察的基因并不完全相同，因此许多研究者往往需要针对自己感兴趣的一些基因进行表达分析。定制芯片服务的目的，就在于满足不同研究者的需要。另外，有些物种尚没有商品化的基因芯片可以提供，也需要通过定制芯片来制备。 2011年SBC客户发表的定制芯片文章举例 应用案例1：表达谱芯片研究低氧浓度增强腺苷酸合成的分子机制 Yu WB, Gao SH, Yin CY, Zhou Y, Ye BC. Comparative
最近，在后基因组时代纷繁的信息中，生物芯片看起来成了最重要的研究工具之一。生物芯片与电子工程学中的硅半导体芯片非常相似。高密度小尺寸的DNA和蛋白质芯片被用来筛选生物信息，以便于更快更好的研究。DNA芯片是现代芯片技术中最成功的案例。DNA技术使用了DNA双螺旋链中A-T和G-C这样的Watson-Crick对的的典型的性质以及对互补序列识别的性质。换句话说，DNA芯片上的单链被当作诱饵，而当加入DNA试样时候，只有其互补链与之成键。DNA芯片能包含数千到数十万种DNA诱饵，这样就可以筛选
、中生北控董事长兼总裁吴乐斌先生、罗氏诊断美国首席技术官Mr. Tomas Li、Life Technologies 公司亚太区应用市场部业务总监曹承治先生、生物芯片上海国家工程研究中心执行主任肖华胜博士等众多业内重要嘉宾作了发言。 此外，本次论坛还特设了Q&A环节，对分子诊断、个体化医疗等技术的应用、国内外IVD 市场发展趋势、临床应用情况等进行探讨。 3月22日下午，在 “分子诊断Q&A”专场上，来自上海交通大学的秦胜营教授、厦门艾德生物医药科技有限公司郑立谋先生、生物芯片上海
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