泛癌大panel（Universal Pan-Cancer

IDT埃德特的Universal Pan-Cancer Panel是一款提供全面、精准、全流程的肿瘤大Panel检测的产品，该款Panel检测覆盖基因组约2.6Mb区域，覆盖靶向实体瘤研究中被广泛关注的565个基因（含HLA基因）的全部编码区，一系列与常见融合相关的38个UTR/内含子区域，以及经典的微卫星序列；支持检测包括碱基替换（SNP）、插入/缺失（In/Del）、拷贝数变异（CNV）、融合基因（Fusion）、微卫星不稳定（MSI）等在内的多种变异信息。

全流程

• 即用型panel

• 经过严格的实验验证

• 整体解决方案（可搭配IDT的建库、捕获产品、接头和buffer）

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全面

• 2.6 Mb panel

• 565个基因的全部编码区

• 38个UTR/内含子（Intron）区域

• 14个微卫星不稳定（MSI）位点

性能优异

• 比对率 >99%

• 捕获效率(On-target rate)  >83%

• 均一性

碱基罚分（Fold 80）<1.5

0.2× Mean Depth  >97

0.5× Mean Depth  >90

 

Universal Pan-Cancer

提供端到端的整体解决方案



经严谨的实验验证

 

样本类型	标准品1：人类女性基因DNA（Promega，G1521） 标准品2：Horizon HD753 肿瘤结构变异，~5% AF  （HD753） 标准品3：Horizon HD701 肿瘤SNV，1-25% AF （HD701） 标准品4：Horizon HD752 肿瘤gDNA （HD752）
建库方法	IDT cfDNA & FFPE 文库构建试剂盒（原Prism） + UDI
捕获方法	IDT buffer + blocker +Universal Pan-Cancer Panel （6杂）
测序平台	Illumina NovaSeq 6000 PE 150

产品表现
 

捕获性能

如下图为采用4个标准品，一个正常样本，3个肿瘤样本，2次重复实验所测实验数据。其捕获数据比对率达99%以上，捕获效率（On-target rate）达83%以上。在0.2x平均测序深度下，目标区域占比达97%以上。碱基罚分（Fold 80）< 1.5。由此可见，该产品具有高比对率、高捕获效率和目标区域覆盖度高等特性。

 

变异检测性能

如下图是对样本中碱基替换（SNV），插入/缺失（InDel）、融合基因（Fusion）以及拷贝数变异（CNV）的检测结果，可见使用IDT Universal Pan-Cancer Panel捕获数据实测变异频率与标准品频率高度一致，数据结果高度一致。

批间稳定性

下图为采用不同批号的Pan-Cancer Panel对基因组文库进行杂交捕获，对捕获到的样品进行测序。测序数据进行均一化处理后，不同批次的探针显示出良好的一致性。

 

现仁科生物联合IDT埃德特为您提供

Universal Pan-Cancer Panel

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试用有限，先到先得，速速联系区域销售或发邮件至marketing@bio-star.cn