OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0

OncoFu Elite (for RNA) Panel v

1.0
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  • #1001511(96rxn) #1001512(16rxn)
  • 中国南京
  • 2025年12月10日
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      OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0

    • 供应商

      纳昂达(南京)

    • 保存条件

      -20℃

    基因列表及覆盖区域信息

    ABL1*†

    ABL2

    AKT3

    ALK

    ARHGAP26

    AXL

    BCL2

    BCOR*

    BRAF

    BRD3*

    BRD4*

    CAMTA1

    CCNB3*

    CCND1

    CIC

    COL6A3

    CSF1R

    DNAJB1

    EGFR

    EML4

    EPC1*

    ERBB2

    ERG*

    ESR1

    ETS1

    ETV1*

    ETV4

    ETV5*

    ETV6*

    EWSR1

    FGFR1

    FGFR2

    FGFR3

    FGR*

    FLI1

    FLT3

    FOSB

    FOXO1

    FUS

    GLI1

    HMGA2

    INSR

    JAK2*

    JAK3

    JAZF1

    KIF5B

    KIT

    KMT2A

    MAML2

    MAST1

    MAST2

    MEAF6

    MET*

    MLLT3

    MSH2

    MSMB

    MUSK

    MYB

    MYC

    NCOA1*

    NCOA2*

    NOTCH1

    NOTCH2

    NOTCH3

    NR4A3*

    NRG1

    NTRK1

    NTRK2

    NTRK3

    NUMBL

    NUTM1

    PAX3

    PAX7

    PDGFB

    PDGFRA

    PDGFRB

    PHF1*

    PIK3CA*

    PKN1

    PLAG1*

    PPARG*

    PRKACA

    PRKCA

    PRKCB

    RAF1

    RARA*

    RELA

    RET

    ROS1

    RSPO2*

    RSPO3

    SS18

    STAT6*

    TAF15

    TCF12

    TCF3

    TERT

    TFE3

    TFEB

    TFG

    THADA

    TMPRSS2*†

    TP53*

    USP6*

    YWHAE*

         

     

    * 覆盖全部 5'-UTR;†覆盖全部 3'-UTR。

    产品表现

    捕获表现

    figure 1

     

    图 1. OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 的捕获表现。A. 典型的捕获测序数据组成,B. 捕获测序与RNAseq数据靶基因相对丰度的比较。 Human Brain Total RNA 标准品 (HBR,Clontech,货号:636530) 利用 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒系列建库,分别进行:直接测序 (RNAseq),或 RNA 捕获测序 (OncoFu E)。

    融合检测示例

    figure 2

    图 2.OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 应用于 FFPE 融合 RNA 参考品的基因融合分析示例。A. OncoFu E 靶向富集与 RNAseq 的比较;B. 参考品倍数稀释后OncoFu E 的靶向富集表现。100 ng Seraseq® FFPE Tumor Fusion RNA v4 Reference Material利用 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒系列建库,分别进行:直接测序 (RNAseq),去除 rRNA 测序 (rRNA-depleted RNAseq,NEBNext rRNA Depletion Kit v2) 和 RNA 捕获测序 (OncoFu E),并取 1 Gb 数据量进行融合分析 (FusionCatcher v1.10)。

    本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。

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