MHY-1685,27406-31-1

基于极性与非极性氨基酸的“二元组图” 进行蛋白质设计

蛋白质的结构通过 NMR 获得解析，均是所设计的有序的四螺旋束结构 [ 12，31 ]。 2.2 密码子的应用 正如 9.1 节中提到的，简并密码子 NAN 和 NTN 分别编码极性和非极性氨基酸残基（图 9.2)。然而，在 N 位置仅简单的使用等量的 A、C、T、G 碱基的混合物会给序列引入不良特性。更为重要的是，未加限制的 NAN 密码子有很高的概率编码终止密码子 ( 即每 16 个 NAN 密码子中就有 2 个终止密码子，概率为 12.5% ) 。下面是我们使用的设计极性与非极性密码

Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆

筛选表达正确折叠的、稳定的和可以与其他分子（蛋白质、核酸、有机底物、过渡态类似物等）结合的多肽。目前建立的最完善的方法是噬菌体展示 [4，5，27]；综述 [ 28 〜30 ]，该方法将文库的扩增和筛选分开，分别在体内和体外进行，适用于与可以容易地固定在固体介质上的小分子或小肽结合的蛋白质，但不太适用于蛋白质与蛋白质相互作用研究或文库间筛选。近来，蛋白质片段互补检测（PCA) 成为一个替代选择 [ 31〜34 ] 。PCA 的策略是，将两个蛋白质分别与报告蛋白或酶的两个片段融合表达，两个目的

盘绕螺旋结构的设计和优化技巧

和 N 的等摩尔混合[ 31] 。核心 a 位和 d 位的序列来自于GCN4  (见注 2 )，而 b 位、c 位和 f 位的序列（有下画线）来自 c-Jun  (  R LEEK  VILKQ   NLA T AN M LR EQ   VA Q L ) 和 c-Fos  ( TTLQ  E TLE Q E   K Y A L Q T E   IA N L L K E KSL) 的盘绕螺旋结构域。 8. GCN4-pVL 变体的序列是 ArR  MKQ LED K VEELSK  YH LEN