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无锡云萃生物
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文献和实验qplot() 函数及 ggplot() 函数。一、plot() 函数绘制简单散点图代码如下：结果如下：四种方式绘制的图片（上图）都一样。第一种方式，x 代表以何变量作为散点图的横坐标，y 代表以何变量作为散点图的纵坐标；第二种方式为第一种方式的简写，默认第一个变量为散点图的横坐标，第二个变量为散点图的纵坐标；第三种方式和第四种方式采用了 R 公式的写法，符号「～」前作为散点图的纵坐标，符号「～」后作为散点图的纵坐标，第三种方式直接调用向量，而第四种方式用 data 参数指定绘图的数据框。二、qplot
测序技术的火爆程度，大家有目共睹，做了测序就一定会涉及差异分析的表达，差异分析最常用的就是「火山图」和「热图」了。看看这两种图形在顶级期刊中的出场率！图片来源：各期刊截图这两种图形最常用的是用 R 语言绘制，但很多人不知道 GraphPad prism 软件同样也可实现。今天，我们就两种图形的 R 语言和 GraphPad prism 画法进行教学！小伙伴们选择适合自己的就行。一、火山图火山图展示的是差异分子的显著性（P火山图的优点是直观待筛的展示分子的整体差异变化结果。但是不能展示每个样本
【GEO 应用】GEO2R 分析工具更新大解析！不会 R 也能做生信
，这些图可以帮助我们评估样本分组的标准化。也就是说，它们可以帮助我们确定我们设置的分组及其数据是否适合进行进一步分析，以及帮助我们判断是否需要对测试分组进行调整。 当然，最重要的是这些图竟然可以在文章中直接使用，零代码出这么多漂亮又实用的图。 这些新增加的功能不仅可以让我们更好的分析挖掘 GEO 数据，而且可以让不会 R 语言编程的研究者也可以进行数据统计分析，为进一步寻找分析差异基因和撰写生物信息文章带来了许多便利。 下面，笔者将对 GEO2R 的使用和新功能进行一下简要的介绍。 一、序列号检索
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